【保存条件】
-20℃保存,有效期12个月
【概述】
本试剂盒利用分步裂解法,通过优化不同缓冲液的离子强度和去污剂浓度,先破坏细胞质膜释放胞浆蛋白,再通过离心收集完整的细胞核,最后裂解细胞核释放核蛋白。提取的蛋白保持天然活性,可用于 Western Blot、EMSA、转录因子活性分析等下游实验。
【实验准备】
1. 试剂准备:将CE I、CE II和NE溶液置于冰上融解,使用前混匀。
2. 抑制剂添加:使用前数分钟内,向所需体积的抽提液中加入蛋白酶抑制剂。
按推荐比例加入相应的蛋白酶或蛋白酶/磷酸酶抑制剂混合物(如ES-8315蛋白酶抑制剂混合物Cocktail(通用型, 100×)或ES-8317 蛋白酶磷酸酶抑制剂混合物(All-in-one,50×),现配现用)。
3. 样本起始量及预处理:
贴壁细胞:2×106细胞(约20 µL细胞沉淀体积)。用预冷PBS洗一遍,用细胞刮刀刮下细胞,或用EDTA溶液处理细胞使细胞不再贴壁很紧,并用移液器吹打下细胞。500×g离心5分钟收集细胞,尽最大努力吸尽上清,留下细胞沉淀备用。尽量避免用胰酶消化细胞,以免胰酶降解需抽提的目的蛋白。
悬浮细胞:2×106细胞(约20 µL细胞沉淀体积)。4℃条件下以500×g离心5分钟收集细胞,期间使用预冷PBS洗涤一次。
组织:约30-60mg组织。首选新鲜采集的组织;如果是冻存组织,必须从-80℃直接取出后迅速切碎,严禁室温自然解冻(解冻过程中产生的冰晶会刺破溶酶体造成蛋白降解)。
【操作步骤】
第一阶段:样本前处理
A. 培养细胞(贴壁/悬浮) | B.组织样本 |
(1) 收集:离心收集细胞(约2×106细胞),用预冷PBS洗涤1次。 (2) 除液:彻底吸干上清,留下细胞沉淀备用。 (3) 下接:直接进入第二阶段步骤2。 | (1) 剪碎:将组织尽可能剪碎成微小碎片。 (2) 配液:按20:1比例预混CE I与CE II,配制成“组织匀浆液”。 (3) 匀浆:按每60 mg组织加入200 µL组织匀浆液的比例,使用玻璃匀浆器在冰上充分匀浆(选择机械匀浆仪更优。若使用组织30mg则使用量减半,下述实验步骤亦减半试剂用量)。 (4) 粗提:将匀浆液转至离心管,冰浴15分钟。随后4℃, 1,500×g离心5分钟。 (5) 下接:吸取上清(含部分胞浆蛋白)暂存;将沉淀接第二阶段步骤2操作。 |
第二阶段:胞浆蛋白提取
2. 重悬:向上一步骤细胞沉淀中加入200µL CE I(含抑制剂)。
3. 分散:最高速剧烈涡旋5-10秒,使细胞完全悬浮分散。
4. 冰浴孵育:置于冰上孵育10-15分钟,期间可涡旋2-3次。
5. 胞浆促裂:加入10µL CE II,最高速剧烈涡旋5-10秒。若沉淀未完全分散,可适当延长涡旋时间。
6. 冰浴平衡:冰浴1分钟。
7. 离心:4℃下,12,000 ×g离心5分钟。
8. 收集胞浆蛋白:立即吸取上清至预冷管中,即为细胞浆蛋白。
第三阶段:核蛋白提取
9. 沉淀洗涤(可选):为防止胞浆蛋白污染,请彻底吸干余液。若沉淀较粘稠或对纯度要求极高,可用200µL PBS重悬后再次离心弃上清。
10. 核裂解:向沉淀中加入50µL NE(含抑制剂)。
11. 释放:剧烈涡旋重悬沉淀,冰上孵育10分钟。注意:期间每隔2分钟需剧烈涡旋5秒,以助核蛋白充分释放。
12. 收集核蛋白:4℃下,12,000-16,000 ×g离心10分钟。收集上清即为细胞核蛋白。
【注意事项】
1. 全程低温:全过程(包括离心、匀浆、涡旋间隙)必须在4°C或冰上进行,预冷离心管和离心机是实验成功的保障。
2. 交叉污染防控:吸取胞浆蛋白时切勿触及核沉淀;提取核蛋白前务必吸净残余胞浆液。
3. 配制建议:抑制剂添加后的CE I和NE必须现配现用。严禁将添加了抑制剂的提取液长期储存,以免抑制剂失效影响实验结果。
4. 得率参考:每2×106细胞约得胞浆蛋白2-5mg/mL,核蛋白1.2-3.0mg/mL。新鲜肝脏组织约得细胞浆蛋白3-10mg/mL,核蛋白3-10mg/mL,结果随样本种类和状态有所波动。
5. DNA拖尾处理:若核蛋白电泳拖尾,说明DNA含量过高。可在步骤11结束后进行短时间超声处理(如30W, 3s)以剪切DNA。
6. 匀浆标准化:坚韧组织若匀浆不彻底,细胞核会包裹在组织碎屑中导致得率下降。建议使用机械匀浆。