【保存条件】
-20 ℃保存,有效期12个月
【概述】
本产品专为单链寡核苷酸(Oligo)的杂交退火设计,适用于-5-500 bp的DNA片段。
l 核心优势:特别优化了针对RNAi (shRNA)和CRISPR (gRNA) 载体构建中复杂序列的退火效果。由于此类序列常含有约20 bp的互补回文序列,极易形成内部发夹结构;本缓冲液能有效抑制自身折叠,诱导两条Oligo正确配对。
l 应用场景:退火产物可直接用于经酶切、纯化的质粒连接反应,转化效率高,阳性克隆比例大。
【操作方法】
I.体系配制(如下20 µl体系为例)
Reagent试剂 | Amount 试剂量 |
正链Oligo(10μM) 负链Oligo(10μM) ddH2O Annealing Buffer(10x) | 5μl 5μl 8 μl 2μl |
20μl |
II. 退火条件
方式A:PCR 仪程序(进阶方案,推荐)
Cycles | Temperature | Time | ||
Simple Protocol 简易步骤 | Step 1: | 1 | 95°C | 5 min |
Step 2: | 70 | 95°C (-1°C/cycle ) | 1 min | |
Step 3: | 4°C | HOLD | ||
Cycles | Temperature | Time | ||
Advanced Protocol 进阶操作步骤 (以Tm值55°C为例) | Step 1: | 1 | 95°C | 5 min |
Step 2: | 40* | 95°C (-1°C/cycle ) | 1 min | |
Step 3: | 1 | 55°C | 30min | |
Step 4: | 20 | 55°C* (-1°C/cycle ) | 1min | |
Step 5: | 4°C | HOLD |
*步骤2和4中的循环数取决于要退火的寡核苷酸的Tm。
方式 B:传统水浴/干浴法(简易方案)
1.将混合好的离心管置于95°C 加热模块或水浴锅中。
2.保持95°C孵育5 min。
3.关闭电源,将离心管留在模块/水浴中,使其随温自然冷却至室温(通常需1-2小时)。
注:冷却至室温前切勿中途取出或直接放入冰上,骤降温会导致大量错配或发夹形成。
【注意事项】
1. Oligo 纯度:建议使用经过 PAGE 纯化更高方式纯化的Oli go(更高纯度决定成功概率),杂质可能会降低退火效率。
2. 浓度匹配:为获得最高比例的双链片段,正负链应严格按照 1:1 摩尔比混合。
3. 稀释建议:退火后的双链 Oligo 浓度较高(本体系为2.5 μM),在与质粒连接前,通常需要用 ddH2O或1× Annealing Buffer稀释10-100倍。
4. 安全防护:仅限科研使用。操作时请穿戴实验服、一次性手套和口罩。