EK-1315 FastPure细胞质和细胞核RNA提取试剂盒

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EK-1315 FastPure细胞质和细胞核RNA提取试剂盒
货号 (Catalog Number): EK-1315

产品描述

产品介绍

本试剂盒可以快速地从哺乳动物细胞或组织中提取细胞质或细胞核RNA,不含酚氯仿等有毒试剂。其提取的总RNA纯度高,无蛋白质及其它杂质污染,可用于RT-PCR、Real Time RT-PCR、mRNA差异显示、分子克隆等多种下游实验。本产品仅供科研使用,请勿用于医药、临床治疗、食品级化妆品等用途。


存储条件

Buffer RN收到后置于2-8℃保存;Buffer RT可室温(15℃-25℃)干燥放置至少一年;其他试剂室温干燥保存可至少稳定12个月。


需要额外准备的材料

1. 14.3 M β-巯基乙醇(β-ME) (常规购买商业化商品即为14.3 M)或2M DTT

2. 70%乙醇:RNase-Free水配制

3. 无水乙醇(96%-100%)

4. 无酶1.5ml离心管

5. 无酶吸头

6. 干净的手套

7.  物理研磨设备


开始前注意事项 请务必在使用本试剂盒之前阅读此注意事项。

1. 操作前在Buffer RN中加入β-巯基乙醇(β-ME)至终浓度为1%(建议现配现用),如1 ml Buffer RN中加入10μl β-巯基乙醇(或加入20 µl的2 M DTT),每次使用前取部分配置。

2. Buffer RT在储存时可能会形成沉淀,如果有沉淀出现,请37℃加热溶解后室温使用。

3. Buffer RW1作为浓缩液提供,在第一次使用前加入0.25倍体积的乙醇(96-100%)以获得工作溶液。

4. Buffer RPE作为浓缩液提供,在第一次使用前加入4倍体积的乙醇(96-100%)以获得工作溶液。

5. RNase-Free水中不含任何抑菌因子,室温放置或操作时可能会引入细菌或真菌污染,使用时尽量注意,推荐开瓶后分装保存以减少污染风险保证实验稳定性。

6. RNA在Buffer RT中时不会被RNase降解。但提取后继续处理过程中应使用不含RNase的离心管或玻璃器皿。

7. RNA提取操作及离心过程室温进行即可。


操作步骤:

1. 请根据样品种类进行以下步骤(1a为动物细胞,1b为动物组织

1a. 收集动物细胞:悬浮细胞可直接300×g离心5min并仔细吸除上清留沉淀待使用;单层贴壁细胞可通过直接裂解法(吸尽培养基留下贴壁细胞,待步骤2用Buffer RN裂解)或胰酶处理法(吸尽培养基留下贴壁细胞,用PBS清洗细胞,吸除PBS后使用含0.10%-0.25%胰酶使细胞脱落,加入含有血清的培养基使胰酶失活后转入无酶1.5ml离心管中300×g离心5min,吸除上清留沉淀待使用)

注意:收集细胞数量不要超过1×107,收集细胞时一定要将细胞培养基去除干净,可使用PBS清洗1-2次,否则会导致步骤2时细胞裂解不完全,影响RNA与吸附柱的结合,RNA的产量降低。

1b. 动物组织匀浆处理:将5mg-15mg动物组织转移入无酶1.5ml离心管中并加入200μl Buffer RN(动物组织量不要超过15mg)使用前请检查Buffer RN是否加入β-巯基乙醇,使用研磨杵或电动研磨机将动物组织彻底研磨匀浆。使用移液器将裂解物转移到无酶离心管中。在台式离心机中以最大速度离心裂解物10min,离心后将上清(即细胞质RNA)转移至新的无酶管中,沉淀用于核RNA提取。进行步骤4.

2. 加入4℃预冷的180μl Buffer RN(使用前请检查Buffer RN是否加入β-巯基乙醇或DTT)至细胞沉淀中,并于冰上孵育5min。对于未消化收集的培养在3.5cm培养皿中的细胞,可吸净培养基用PBS清洗一次后,直接加入4℃预冷的180μl Buffer RN至细胞培养皿中,然后用细胞刮刀轻轻刮动并转移至无酶1.5ml离心管中,并于冰上孵育5min

对于提前离心沉淀在离心管中的细胞,通过轻弹离心管以使细胞沉淀彻底分散开。悬浮液应迅速澄清,表明质膜立即溶解。注意:细胞沉淀的不完全分散可能导致裂解效率低下和RNA产量降低。

3. 将上述裂解物在4ºC下以300×g离心2min。将上清液转移到新的无酶1.5ml离心管中用于细胞质RNA提取,沉淀用于细胞核RNA提取。如果在此过程的后续步骤中使用相同的离心机,则保持离心室温状态。

上清液含有细胞质提取物。 根据细胞类型的不同,它通常略带混浊和黄白色。 沉淀含有细胞核,上清中为细胞质裂解物。

4. 于步骤3所得细胞质裂解物及细胞沉淀管中分别加入600 µl Buffer RT充分涡旋混匀

若沉淀物较多,可室温裂解3-5min,期间摇匀2-3次。

5. 将430μl无水乙醇(96–100%)分别加入两管裂解物中,并用移液器将其充分混合。不要离心。

注意:从某些细胞系纯化RNA时,加入乙醇后可能会出现沉淀。 这不会影响后续提取过程。

6. 将步骤5混匀后的两管溶液转移入无酶吸附柱中并套上2ml收集管,≥8000×g(≥10,000rpm)离心1min,弃废液,直至将溶液全部转移完成吸附。

吸附柱最大上柱量为700μl,若溶液过多可分多次上柱。后续操作若无特殊说明吸附柱均置于2ml收集管中。

7. 两个吸附柱中分别加入700μl Buffer RW1,≥8000×g(≥10,000 rpm) 离心30s,弃废液。

8. 两个吸附柱重收套回收集管中,向吸附柱中加入500μl Buffer RPE使用前请确认Buffer RPE按要求加入4倍体积无水乙醇,≥8000×g(≥10,000 rpm) 离心30s,弃废液。

9. 重复步骤8一次。

10. 倒弃滤液,将吸附柱放入收集管中, 以最大转速(~13,400×g)离心3min干燥柱子。

11. 两个吸附柱分别套入新的RNase-Free的1.5ml 离心管中,并置于无RNA酶的环境中开盖静置5-10min至乙醇晾干。

若吸附柱中残留乙醇将会对纯化后的RNA的下游实验造成影响。

12. 两个吸附柱膜正中央分别加入30-50μl RNase-Free Water,盖上盖子室温静置3-5 min。后置于离心机中 ≥12,000×g(≥13,000 rpm) 离心3min得到RNA溶液。

产品规格

货期
1-2天
规格
50T、100T

应用领域

本产品适用于EK-1315、RNA提取、生物科研试剂、ECOTOP SCIENTIFIC等研究领域。ECOTOP SCIENTIFIC(广州亿涛生物科技有限公司)提供高品质生物科研试剂,服务科研院所与生物医药企业。

存储条件

2-8℃保存;Buffer RT可室温(15℃-25℃)干燥放置至少一年;其他试剂室温干燥保存

品牌: ECOTOP SCIENTIFIC

常见问题 (FAQ)

提取的 RNA 应如何保存?

短期 -20℃(1 周内);长期 -80℃ 分装储存(每管单次用量),避免反复冻融。重要的细胞核 RNA 样品(含珍稀 lncRNA)建议双管 -80℃ 备份。

可以保留小 RNA(miRNA、snRNA)吗?

本试剂盒兼容大小 RNA(≥18 nt)。胞质 fraction:成熟 miRNA 主要存在;核 fraction:snRNA、snoRNA、未成熟 miRNA 前体(pre-miRNA)富集。如重点研究胞质 miRNA,建议结合 miRNA 专用 cDNA 合成试剂盒(含茎环引物或 polyA 加尾)。

如何判断分馏是否成功?

① qPCR 标志基因法:胞质 marker(GAPDH mRNA、ACTB mRNA)应在胞质 fraction 富集 >10 倍;核 marker(MALAT1、NEAT1 lncRNA、U6 snRNA、未剪切前体 mRNA)应在核 fraction 富集 >5 倍。

组织样品的分馏处理?

取 5–15 mg 组织 + 200 µL Buffer RN(已加 β-ME),研磨匀浆后转入无酶 1.5 mL 离心管,最大速度离心 10 min;离心后上清即细胞质 RNA,转移至新管;沉淀用于核 RNA 提取。后续每管加 600 µL Buffer RT 与 430 µL 无水乙醇上柱(与细胞流程一致)。

分馏的关键操作是什么?

① 细胞 PBS 洗涤 1–2 次(去除培养基蛋白);② 加4℃ 预冷的 180 µL Buffer RN至细胞沉淀,冰上孵育 5 min;③ 4℃ 300×g 离心 2 min——说明书强调:上清液含有细胞质提取物。根据细胞类型的不同,它通常略带混浊和黄白色。沉淀含有细胞核,上清中为细胞质裂解物。;④ 上清入新管做胞质 RNA、沉淀做核 RNA 提取;⑤ 每管加 600 µL Buffer RT 充分涡旋(沉淀物多时室温裂解 3–5 min,期间摇匀 2–3 次);⑥ 每管加 430 µL 无水乙醇充分混匀;⑦ 转入 RNase-free 吸附柱并按 Buffer RW1/RPE 流程纯化。核污染胞质 是分馏失败最常见原因(离心力过大破坏核膜)。

β-巯基乙醇如何配置?

操作前在 Buffer RN 中加入 β-巯基乙醇至终浓度为 1%(建议现配现用),如 1 mL Buffer RN 中加入 10 µL β-ME(或 20 µL 2M DTT),每次使用前取部分配置。Buffer RN 为分馏裂解液,必须加 β-ME;Buffer RT 为后续上柱裂解液,无需加 β-ME。

起始量与典型得率?

① 细胞:≤1×10⁷(PBS 洗涤一次后用 Buffer RN 裂解);② 组织:5–15 mg(说明书强调动物组织量不要超过 15 mg),加 200 µL Buffer RN 研磨匀浆。典型得率(HEK293 1×10⁶):细胞质 RNA 5–15 µg;细胞核 RNA 1–5 µg。

什么样的研究需要分馏 RNA?

典型应用:① lncRNA 亚细胞定位研究(区分核内调控型 vs. 胞质中的 cis/trans 调控型);② mRNA 加工与转运研究(前体 mRNA → 成熟 mRNA 的核 → 胞质转运);③ 核出口受抑研究(如 NXF1 等核出口因子缺陷);④ 病毒感染研究(部分病毒 RNA 主要在核内或胞质内);⑤ 染色质相关 RNA 分析(结合 ChIRP / RAP 研究)。

本试剂盒的核心用途是什么?

本试剂盒用于将细胞中的 RNA 按亚细胞定位分馏:细胞质 RNA(成熟 mRNA、tRNA、miRNA 等)与 细胞核 RNA(前体 mRNA、核 lncRNA、剪切产物、snRNA 等)分别纯化。工艺基于「Buffer RN 温和裂解胞膜(保留核膜完整)+ 4℃ 300×g 离心分离 + 各自 Buffer RT 裂解 + 硅胶膜柱纯化」原理,不含酚氯仿等有毒试剂。

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产品介绍

本试剂盒可以快速地从哺乳动物细胞或组织中提取细胞质或细胞核RNA,不含酚氯仿等有毒试剂。其提取的总RNA纯度高,无蛋白质及其它杂质污染,可用于RT-PCR、Real Time RT-PCR、mRNA差异显示、分子克隆等多种下游实验。本产品仅供科研使用,请勿用于医药、临床治疗、食品级化妆品等用途。


存储条件

Buffer RN收到后置于2-8℃保存;Buffer RT可室温(15℃-25℃)干燥放置至少一年;其他试剂室温干燥保存可至少稳定12个月。


需要额外准备的材料

1. 14.3 M β-巯基乙醇(β-ME) (常规购买商业化商品即为14.3 M)或2M DTT

2. 70%乙醇:RNase-Free水配制

3. 无水乙醇(96%-100%)

4. 无酶1.5ml离心管

5. 无酶吸头

6. 干净的手套

7.  物理研磨设备


开始前注意事项 请务必在使用本试剂盒之前阅读此注意事项。

1. 操作前在Buffer RN中加入β-巯基乙醇(β-ME)至终浓度为1%(建议现配现用),如1 ml Buffer RN中加入10μl β-巯基乙醇(或加入20 µl的2 M DTT),每次使用前取部分配置。

2. Buffer RT在储存时可能会形成沉淀,如果有沉淀出现,请37℃加热溶解后室温使用。

3. Buffer RW1作为浓缩液提供,在第一次使用前加入0.25倍体积的乙醇(96-100%)以获得工作溶液。

4. Buffer RPE作为浓缩液提供,在第一次使用前加入4倍体积的乙醇(96-100%)以获得工作溶液。

5. RNase-Free水中不含任何抑菌因子,室温放置或操作时可能会引入细菌或真菌污染,使用时尽量注意,推荐开瓶后分装保存以减少污染风险保证实验稳定性。

6. RNA在Buffer RT中时不会被RNase降解。但提取后继续处理过程中应使用不含RNase的离心管或玻璃器皿。

7. RNA提取操作及离心过程室温进行即可。


操作步骤:

1. 请根据样品种类进行以下步骤(1a为动物细胞,1b为动物组织

1a. 收集动物细胞:悬浮细胞可直接300×g离心5min并仔细吸除上清留沉淀待使用;单层贴壁细胞可通过直接裂解法(吸尽培养基留下贴壁细胞,待步骤2用Buffer RN裂解)或胰酶处理法(吸尽培养基留下贴壁细胞,用PBS清洗细胞,吸除PBS后使用含0.10%-0.25%胰酶使细胞脱落,加入含有血清的培养基使胰酶失活后转入无酶1.5ml离心管中300×g离心5min,吸除上清留沉淀待使用)

注意:收集细胞数量不要超过1×107,收集细胞时一定要将细胞培养基去除干净,可使用PBS清洗1-2次,否则会导致步骤2时细胞裂解不完全,影响RNA与吸附柱的结合,RNA的产量降低。

1b. 动物组织匀浆处理:将5mg-15mg动物组织转移入无酶1.5ml离心管中并加入200μl Buffer RN(动物组织量不要超过15mg)使用前请检查Buffer RN是否加入β-巯基乙醇,使用研磨杵或电动研磨机将动物组织彻底研磨匀浆。使用移液器将裂解物转移到无酶离心管中。在台式离心机中以最大速度离心裂解物10min,离心后将上清(即细胞质RNA)转移至新的无酶管中,沉淀用于核RNA提取。进行步骤4.

2. 加入4℃预冷的180μl Buffer RN(使用前请检查Buffer RN是否加入β-巯基乙醇或DTT)至细胞沉淀中,并于冰上孵育5min。对于未消化收集的培养在3.5cm培养皿中的细胞,可吸净培养基用PBS清洗一次后,直接加入4℃预冷的180μl Buffer RN至细胞培养皿中,然后用细胞刮刀轻轻刮动并转移至无酶1.5ml离心管中,并于冰上孵育5min

对于提前离心沉淀在离心管中的细胞,通过轻弹离心管以使细胞沉淀彻底分散开。悬浮液应迅速澄清,表明质膜立即溶解。注意:细胞沉淀的不完全分散可能导致裂解效率低下和RNA产量降低。

3. 将上述裂解物在4ºC下以300×g离心2min。将上清液转移到新的无酶1.5ml离心管中用于细胞质RNA提取,沉淀用于细胞核RNA提取。如果在此过程的后续步骤中使用相同的离心机,则保持离心室温状态。

上清液含有细胞质提取物。 根据细胞类型的不同,它通常略带混浊和黄白色。 沉淀含有细胞核,上清中为细胞质裂解物。

4. 于步骤3所得细胞质裂解物及细胞沉淀管中分别加入600 µl Buffer RT充分涡旋混匀

若沉淀物较多,可室温裂解3-5min,期间摇匀2-3次。

5. 将430μl无水乙醇(96–100%)分别加入两管裂解物中,并用移液器将其充分混合。不要离心。

注意:从某些细胞系纯化RNA时,加入乙醇后可能会出现沉淀。 这不会影响后续提取过程。

6. 将步骤5混匀后的两管溶液转移入无酶吸附柱中并套上2ml收集管,≥8000×g(≥10,000rpm)离心1min,弃废液,直至将溶液全部转移完成吸附。

吸附柱最大上柱量为700μl,若溶液过多可分多次上柱。后续操作若无特殊说明吸附柱均置于2ml收集管中。

7. 两个吸附柱中分别加入700μl Buffer RW1,≥8000×g(≥10,000 rpm) 离心30s,弃废液。

8. 两个吸附柱重收套回收集管中,向吸附柱中加入500μl Buffer RPE使用前请确认Buffer RPE按要求加入4倍体积无水乙醇,≥8000×g(≥10,000 rpm) 离心30s,弃废液。

9. 重复步骤8一次。

10. 倒弃滤液,将吸附柱放入收集管中, 以最大转速(~13,400×g)离心3min干燥柱子。

11. 两个吸附柱分别套入新的RNase-Free的1.5ml 离心管中,并置于无RNA酶的环境中开盖静置5-10min至乙醇晾干。

若吸附柱中残留乙醇将会对纯化后的RNA的下游实验造成影响。

12. 两个吸附柱膜正中央分别加入30-50μl RNase-Free Water,盖上盖子室温静置3-5 min。后置于离心机中 ≥12,000×g(≥13,000 rpm) 离心3min得到RNA溶液。

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