EK-1310 FastPure细菌样品RNA提取试剂盒

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EK-1310 FastPure细菌样品RNA提取试剂盒
货号 (Catalog Number): EK-1310

产品描述

产品介绍

本试剂盒可以快速地从革兰氏阴性及阳性菌(≤5×108 Cells)中提取总RNA,不含酚氯仿等有毒试剂。其提取的总RNA纯度高,无蛋白质及其它杂质污染,可用于RT-PCR、Real Time RT-PCR、mRNA差异显示、引物延伸分析、芯片分析、 Northern Blot、Dot Blot、Slot Blot、Poly A筛选、体外翻译、RNase 保护分析和分子克隆等多种下游实验。本产品仅供科研使用,请勿用于医药、临床治疗、食品级化妆品等用途。


存储条件

Lysozyme Solution置于-20℃保存,其他试剂室温干燥保存可至少稳定12个月。


需要额外准备的材料

 14.3 M β-巯基乙醇(β-ME) (常规购买商业化商品即为14.3 M)或2M DTT溶液

 70%乙醇:RNase-Free水配制

 无水乙醇(96%-100%)

 无酶1.5mL离心管

 无酶吸头

 干净的手套

 高速离心机


开始前注意事项 请务必在使用本试剂盒之前阅读此注意事项。

 操作前在Buffer RLT中加入β-巯基乙醇(β-ME)至终浓度为1%(建议现配现用),如1 mL Buffer RLT中加入10μL β-巯基乙醇(或20μL 2M DTT溶液)。配好的Buffer RLT可在4℃维持稳定一个月。

 Buffer RLT在储存时可能会形成沉淀,如果有沉淀出现,请37℃加热溶解后室温使用。

 Buffer RW1作为浓缩液提供,在第一次使用前加入0.25倍体积的乙醇(96-100%)以获得工作溶液。

 Buffer RPE作为浓缩液提供,在第一次使用前加入4倍体积的乙醇(96-100%)以获得工作溶液。

 RNase-Free水中不含任何抑菌因子,室温放置或操作时可能会引入细菌或真菌污染,使用时尽量注意,推荐开瓶后分装保存以减少污染风险保证实验稳定性。

 RNA在Buffer RLT中时不会被RNase降解。但提取后继续处理过程中应使用不含RNase的无酶离心管或玻璃器皿。

 RNA提取操作及离心过程室温进行即可。


操作步骤:

1. 取适量菌液于离心机中室温5,000×g离心10min收集革兰氏阴性或者阳性细菌样品(≤5×108 Cells)。

若需要处理更多细菌,则相应增加后续各种试剂用量。

2. 倒弃培养基,在吸水纸轻轻拍打除尽残液(或用吸头吸尽)

3. 加入100μL Lysozyme Solution,通过上下吹打数次小心地重悬沉淀。

若细菌量较大可按细菌量加倍加入溶菌酶的Buffer TE,后续Buffer RLT也要相应增加体积。

4. 涡旋混匀10s,37°C下孵育10min。在孵育过程中,至少每2min涡旋10s混匀。

5. 加入350μL Buffer RLT使用前请检查Buffer RLT是否加入β-巯基乙醇或DTT并剧烈振荡。如果可见颗粒物质,通过离心将其沉淀,取上清液备用。

6. 添加250μL体积的无水乙醇于步骤5的上清溶液中,通过移液混匀,不要离心。

加入乙醇后可能会形成沉淀为正常现象,这不会影响后续的操作步骤。

7. 将步骤6混匀后的溶液转移入RNase-Free吸附柱中并套上2mL收集管,≥8000×g (≥10,000 rpm)离心30s,弃废液。

吸附柱最大上柱量为700μL,若溶液过多可分多次上柱。后续操作若无特殊说明吸附柱均置于2mL收集管中。

8. 向吸附柱中加入700μL Buffer RW1使用前请确按要求加入相应体积无水乙醇,≥8000×g(≥10,000 rpm) 离心30s,弃废液。

9. 将吸附柱重收套回收集管中,向吸附柱中加入500μL Buffer RPE使用前请确按要求加入相应体积无水乙醇,≥8000×g(≥10,000 rpm) 离心30s,弃废液。

10. 重复操作步骤9一次。

11. 倒弃滤液,将吸附柱放入收集管中, 以最大转速(~13,400×g)离心3min干燥柱子。

12. 将吸附柱套入新的无酶1.5mL 离心管中,并置于无酶环境中开盖静置5-10min至乙醇晾干。

若吸附柱中残留乙醇将会对纯化后的RNA的下游实验造成影响。

13. 向吸附柱膜正中央加入50-100μL RNase-Free Water,盖上盖子室温静置2-3 min。后置于最大转速(~13,400×g)离心3min得到RNA溶液。

RNA洗脱体积不应少于30μL,否则影响洗脱效率。洗脱后的RNA溶液应立即进行下游实验或置于-80℃储存。


常见问题:

1. 柱子堵塞

 样品用量太多:减少样品用量,参照说明书中提供用量建议。

 样品消化不充分:增加Lysozyme Solution用量,延长酶消化孵育时间。

2. RNA产量低

 试剂准备有误:Buffer RPE没有加入乙醇稀释或体积不准确(乙醇浓度需控制在80%)。

 洗脱不充分:洗脱液需加到膜中央,增加洗脱体积或次数。

3. RNA降解严重

 样品保存有误:非新鲜现取样品应尽量保存RNA Holder等保存液中。

 提取过程耗材及环境污染:提取中使用的吸头、离心管等需经无酶处理,环境应尽量选择无酶环境或洁净环境以减少RNase的影响。

产品规格

货期
1-2天
规格
50T、100T

应用领域

本产品适用于EK-1310、RNA提取、生物科研试剂、ECOTOP SCIENTIFIC等研究领域。ECOTOP SCIENTIFIC(广州亿涛生物科技有限公司)提供高品质生物科研试剂,服务科研院所与生物医药企业。

存储条件

-20℃保存,其他试剂室温干燥保存

品牌: ECOTOP SCIENTIFIC

常见问题 (FAQ)

低生物量样品如何提高检出率?

低生物量样品(1×10⁵–1×10⁶ 细胞)建议:① 加大裂解液体积,离心浓缩样品;② 减小洗脱体积(≤30 µL)以提高浓度;③ 必要时联合应用前置富集(如低速离心去宿主、磁珠富集等)。22.10 Q:提取的 RNA 应如何保存? 短期 -20℃(1 周内);长期 -80℃ 分装储存(每管单次用量 + 备份)。

可以用于哪些下游应用?

可用于 RT-PCR、Real Time RT-PCR、mRNA 差异显示、引物延伸分析、芯片分析、Northern Blot、Dot Blot、Slot Blot、Poly A 筛选、体外翻译、RNase 保护分析和分子克隆等多种下游实验。

常见问题排查

① 柱子堵塞——样品用量太多(参照说明书用量建议)/样品消化不充分(增加 Lysozyme Solution 用量,延长酶消化孵育时间);② RNA 产量低——试剂准备有误(Buffer RPE 没有加入乙醇稀释或体积不准确,乙醇浓度需控制在 80%)/洗脱不充分(洗脱液需加到膜中央,增加洗脱体积或次数);③ RNA 降解严重——样品保存有误(非新鲜现取样品应尽量保存 RNA Holder 等保存液中)/提取过程耗材及环境污染。

mRNA 半衰期短,如何保护?

关键策略:RNA 保护剂第一时间加入。流程要点:① 取样后立即加 RNA 保护剂(ES-8735 Simple Protect通用型样本保存液、EK-5302 RNA Holder-RNA组织保护液等);② 加入后短时涡旋混匀(不要预冷);③ 4℃ 保存 24 h 或 -80℃ 长期保存。避免:先离心收菌再加裂解液(离心过程 mRNA 已开始降解);冰浴下储存未保护的菌液(低温下转录虽减慢但 RNase 仍活跃)。

阳性菌细胞壁如何高效破除?

① 收集菌体后弃培养基;② 加 100 µL Lysozyme Solution,上下吹打数次重悬沉淀(说明书提示:若细菌量较大可按细菌量加倍加入溶菌酶的 Buffer TE,后续 Buffer RLT 也要相应增加体积);③ 涡旋混匀 10 s,37℃ 孵育 10 min(每 2 min 涡旋 10 s 混匀);④ 加 350 µL Buffer RLT 剧烈振荡。特殊菌:Mycobacterium / Streptococcus 加 mutanolysin、muramidase;产气荚膜梭菌等需要 lysostaphin;难裂解阳性菌可延长 Lysozyme 孵育至 30–60 min。

β-巯基乙醇或 DTT 是必加的吗?

建议添加,熟悉RNA提取人员可不加。操作前在 Buffer RLT 中加入 β-巯基乙醇至终浓度为 1%(建议现配现用),如 1 mL Buffer RLT 中加入 10 µL β-ME(或 20 µL 2M DTT 溶液)。配好的 Buffer RLT 可在 4℃ 维持稳定一个月。

起始量与典型得率?

取适量菌液,室温 5,000×g 离心 10 min 收集革兰氏阴性或阳性细菌(≤5×10⁸ Cells)。若需要处理更多细菌,则相应增加后续各种试剂用量。E. coli 5×10⁸ 细胞典型得率 30–100 µg;阳性菌(Bacillus、Staphylococcus)20–60 µg。

细菌 RNA 提取的核心难点是什么?

细菌 RNA 面临三大挑战:① 细胞壁难破(特别是革兰氏阳性菌的肽聚糖层);② mRNA 半衰期极短(细菌 mRNA 半衰期 1–10 min);③ rRNA 占比高(80–90%)。本试剂盒采用「Lysozyme Solution 预处理 + Buffer RLT 异硫氰酸胍裂解 + 硅胶膜柱纯化」工艺,不含酚氯仿等有毒试剂,适用于革兰氏阴性及阳性菌(≤5×10⁸ Cells)。

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常见问题解答(8)
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产品介绍

本试剂盒可以快速地从革兰氏阴性及阳性菌(≤5×108 Cells)中提取总RNA,不含酚氯仿等有毒试剂。其提取的总RNA纯度高,无蛋白质及其它杂质污染,可用于RT-PCR、Real Time RT-PCR、mRNA差异显示、引物延伸分析、芯片分析、 Northern Blot、Dot Blot、Slot Blot、Poly A筛选、体外翻译、RNase 保护分析和分子克隆等多种下游实验。本产品仅供科研使用,请勿用于医药、临床治疗、食品级化妆品等用途。


存储条件

Lysozyme Solution置于-20℃保存,其他试剂室温干燥保存可至少稳定12个月。


需要额外准备的材料

 14.3 M β-巯基乙醇(β-ME) (常规购买商业化商品即为14.3 M)或2M DTT溶液

 70%乙醇:RNase-Free水配制

 无水乙醇(96%-100%)

 无酶1.5mL离心管

 无酶吸头

 干净的手套

 高速离心机


开始前注意事项 请务必在使用本试剂盒之前阅读此注意事项。

 操作前在Buffer RLT中加入β-巯基乙醇(β-ME)至终浓度为1%(建议现配现用),如1 mL Buffer RLT中加入10μL β-巯基乙醇(或20μL 2M DTT溶液)。配好的Buffer RLT可在4℃维持稳定一个月。

 Buffer RLT在储存时可能会形成沉淀,如果有沉淀出现,请37℃加热溶解后室温使用。

 Buffer RW1作为浓缩液提供,在第一次使用前加入0.25倍体积的乙醇(96-100%)以获得工作溶液。

 Buffer RPE作为浓缩液提供,在第一次使用前加入4倍体积的乙醇(96-100%)以获得工作溶液。

 RNase-Free水中不含任何抑菌因子,室温放置或操作时可能会引入细菌或真菌污染,使用时尽量注意,推荐开瓶后分装保存以减少污染风险保证实验稳定性。

 RNA在Buffer RLT中时不会被RNase降解。但提取后继续处理过程中应使用不含RNase的无酶离心管或玻璃器皿。

 RNA提取操作及离心过程室温进行即可。


操作步骤:

1. 取适量菌液于离心机中室温5,000×g离心10min收集革兰氏阴性或者阳性细菌样品(≤5×108 Cells)。

若需要处理更多细菌,则相应增加后续各种试剂用量。

2. 倒弃培养基,在吸水纸轻轻拍打除尽残液(或用吸头吸尽)

3. 加入100μL Lysozyme Solution,通过上下吹打数次小心地重悬沉淀。

若细菌量较大可按细菌量加倍加入溶菌酶的Buffer TE,后续Buffer RLT也要相应增加体积。

4. 涡旋混匀10s,37°C下孵育10min。在孵育过程中,至少每2min涡旋10s混匀。

5. 加入350μL Buffer RLT使用前请检查Buffer RLT是否加入β-巯基乙醇或DTT并剧烈振荡。如果可见颗粒物质,通过离心将其沉淀,取上清液备用。

6. 添加250μL体积的无水乙醇于步骤5的上清溶液中,通过移液混匀,不要离心。

加入乙醇后可能会形成沉淀为正常现象,这不会影响后续的操作步骤。

7. 将步骤6混匀后的溶液转移入RNase-Free吸附柱中并套上2mL收集管,≥8000×g (≥10,000 rpm)离心30s,弃废液。

吸附柱最大上柱量为700μL,若溶液过多可分多次上柱。后续操作若无特殊说明吸附柱均置于2mL收集管中。

8. 向吸附柱中加入700μL Buffer RW1使用前请确按要求加入相应体积无水乙醇,≥8000×g(≥10,000 rpm) 离心30s,弃废液。

9. 将吸附柱重收套回收集管中,向吸附柱中加入500μL Buffer RPE使用前请确按要求加入相应体积无水乙醇,≥8000×g(≥10,000 rpm) 离心30s,弃废液。

10. 重复操作步骤9一次。

11. 倒弃滤液,将吸附柱放入收集管中, 以最大转速(~13,400×g)离心3min干燥柱子。

12. 将吸附柱套入新的无酶1.5mL 离心管中,并置于无酶环境中开盖静置5-10min至乙醇晾干。

若吸附柱中残留乙醇将会对纯化后的RNA的下游实验造成影响。

13. 向吸附柱膜正中央加入50-100μL RNase-Free Water,盖上盖子室温静置2-3 min。后置于最大转速(~13,400×g)离心3min得到RNA溶液。

RNA洗脱体积不应少于30μL,否则影响洗脱效率。洗脱后的RNA溶液应立即进行下游实验或置于-80℃储存。


常见问题:

1. 柱子堵塞

 样品用量太多:减少样品用量,参照说明书中提供用量建议。

 样品消化不充分:增加Lysozyme Solution用量,延长酶消化孵育时间。

2. RNA产量低

 试剂准备有误:Buffer RPE没有加入乙醇稀释或体积不准确(乙醇浓度需控制在80%)。

 洗脱不充分:洗脱液需加到膜中央,增加洗脱体积或次数。

3. RNA降解严重

 样品保存有误:非新鲜现取样品应尽量保存RNA Holder等保存液中。

 提取过程耗材及环境污染:提取中使用的吸头、离心管等需经无酶处理,环境应尽量选择无酶环境或洁净环境以减少RNase的影响。

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