EK-1309 FastPure真菌样品RNA提取试剂盒

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EK-1309 FastPure真菌样品RNA提取试剂盒
货号 (Catalog Number): EK-1309

产品描述


产品介绍

本试剂盒可以快速地从真菌(酵母)中提取总RNA,不含酚氯仿等有毒试剂。其提取的总RNA纯度高,可用于RT-PCR、Real Time RT-PCR、mRNA差异显示、引物延伸分析、芯片分析、 Northern Blot、Dot Blot、Slot Blot、Poly A 筛选、体外翻译、RNase 保护分析和分子克隆等多种下游实验。本产品仅供科研使用,请勿用于医药、临床治疗、食品级化妆品等用途。


存储条件

Buffer Y1收到后置于-20℃保存;Buffer RLT可室温(15℃-25℃)干燥放置至少一年,加入β-巯基乙醇(或DTT)的Buffer RLT可4℃放置一个月;其他试剂室温干燥保存可至少稳定12个月。


需要额外准备的材料

 14.3 M β-巯基乙醇(β-ME) (常规购买商业化商品即为14.3 M)或1M DTT溶液

 70%乙醇:RNase-free水配制

 无水乙醇(96%-100%)

 无RNase酶的1.5mL离心管

 无RNase酶的吸头

 干净的手套

  高速离心机


开始前注意事项 请务必在使用本试剂盒之前阅读此注意事项。

 操作前在Buffer RLT中加入β-巯基乙醇(或DTT)至终浓度为1%(建议现配现用,DTT终浓度为约40mM),如1 mL Buffer RLT中加入10μL β-巯基乙醇(或40μL 1M DTT溶液)。配好的Buffer RLT可在4℃维持稳定一个月。

 Buffer RLT在储存时可能会形成沉淀, 如果有沉淀出现,请37℃加热溶解后室温使用。

 Buffer RW1作为浓缩液提供,在第一次使用前加入0.25倍体积的乙醇(96-100%)以获得工作溶液。

 Buffer RPE作为浓缩液提供,在第一次使用前加入4倍体积的乙醇(96-100%)以获得工作溶液。

 RNase-free水中不含任何抑菌因子,室温放置或操作时可能会引入细菌或真菌污染,使用时尽量注意,推荐开瓶后分装保存以减少污染风险保证实验稳定性。

 RNA在Buffer RLT中时不会被RNase降解。但提取后继续处理过程中应使用不含RNase的无酶离心管或玻璃器皿。


操作步骤:

1. 将真菌溶液(≤2×107新鲜真菌(或酵母))在4°C下以1000×g离心5分钟,在12mL或15mL的离心管中收集细胞沉淀。

2. 破壁处理(根据样本类型选择路径A或路径B):

路径A:酶消化法(推荐用于酵母)

① 加入200μL无菌PBS将沉淀重悬,并转移至新的无酶1.5 mL离心管中。

② 加入10 μL Buffer Y1,在30°C下轻轻摇晃孵育30-40 min。

③ 孵育结束后,直接进入步骤3(裂解)。

路径B:路径 B:物理粉碎法(推荐用于难裂真菌如丝状真菌,得率更高)

① 液氮研磨:将沉淀在液氮中研磨成精细粉末。

② 机械匀浆:或使用高通量研磨仪/破碎机配合无酶珠子进行粉碎。

③ 粉碎完成后,将样本转移至无酶1.5 mL离心管中,直接进入步骤3(裂解)。

3. 加入350μL Buffer RLT并充分涡旋1分钟以解真菌。全速 (~13,400×g)离心2分钟,弃沉淀并在后续步骤中仅使用上清液。
若离心后上清液仍显著粘稠(多见于多糖含量高的样本),可补加0.5倍体积(约175μL)的Buffer RLT 稀释混匀。注意:若补加了 RLT,步骤4的无水乙醇用量也要相应增加,保持与裂解液总量1:1的比例。

4. 在上清液中加入1倍体积无水乙醇(约350μL),并通过移液混合均匀。不要离心。立即进入下一步。

5. 将上述步骤溶液转移入RNase-free吸附柱中并套上2mL收集管,≥8000x g(≥10,000rpm)离心1min,弃废液,直至将溶液全部转移完成吸附。

吸附柱最大上柱量为700μL,若溶液过多可分多次上柱。后续操作若无特殊说明吸附柱均置于2mL收集管中。

6. 向吸附柱中加入700μL Buffer RW1使用前请确认Buffer RW1按要求加入0.25倍体积无水乙醇,≥8000×g(≥10,000 rpm) 离心30s,弃废液。

7. 将吸附柱重收套回收集管中,向吸附柱中加入500μL Buffer RPE(使用前请确认Buffer RPE按要求加入4倍体积无水乙醇),≥8000×g(≥10,000 rpm) 离心30s,弃废液。

8. 重复步骤7一次。

9. 倒弃滤液,将吸附柱放入收集管中, 以最大转速(~13,400×g)离心3分钟干燥柱子。

10. 将吸附柱套入新的无酶1.5mL 离心管中,并置于无酶环境中开盖静置5-10min至乙醇晾干。

若吸附柱中残留乙醇将会对纯化后的RNA的下游实验造成影响。

11. 向吸附柱膜正中央加入50-100μL RNase-FreeWater,盖上盖子室温静置2-3 min。后置于离心机中最大转速(~13,400×g)离心2min得到RNA溶液。

RNA洗脱体积不应少于30μL,否则影响洗脱效率。洗脱后的RNA溶液应立即进行下游实验或置于-80℃储存。


常见问题:

1. 柱子堵塞

 样品用量太多:减少样品用量,参照说明书中提供用量建议。

 样品消化不充分:用液氮或研磨仪充分研磨,延长研磨时间。

2. RNA产量低

 试剂准备有误:Buffer RPE没有加入乙醇稀释或体积不准确(乙醇浓度需控制在80%)。

 洗脱不充分:洗脱液需加到膜中央,增加洗脱体积或次数。

3. RNA降解严重

样品保存有误:非新鲜现取样品应尽量保存RNA Holder等保存液中。

提取过程耗材及环境污染:提取中使用的吸头、离心管等需经无酶处理,环境应尽量选择无酶环境或洁净环境以减少RNase的影响。

产品规格

货期
1-2天
规格
50T、100T

应用领域

本产品适用于EK-1309、RNA提取、生物科研试剂、ECOTOP SCIENTIFIC等研究领域。ECOTOP SCIENTIFIC(广州亿涛生物科技有限公司)提供高品质生物科研试剂,服务科研院所与生物医药企业。

存储条件

-20℃保存

品牌: ECOTOP SCIENTIFIC

常见问题 (FAQ)

提取的 RNA 应如何保存?

短期 -20℃(1 周内);长期 -80℃ 分装储存(每管单次用量 + 备份)。

分生孢子(conidia)RNA 提取为何更困难?

分生孢子壁极厚(多层几丁质 + 疏水性蛋白)且代谢活性低、RNA 含量稀少。优化建议:① 必须机械破壁(路径 B:锆珠 + 球磨仪 30Hz × 3 min,3–5 个循环);② 必要时在 Buffer RLT 中额外加 SDS(1%)+ β-ME(1%)促进破壁;③ 65℃ 处理时间延长至 1 h;④ 必要时加热-冻融循环(液氮 ↔ 65℃ 各 2 min,3 次)。

典型得率与 RIN 值?

酵母 2×10⁷ 细胞典型得率 30–80 µg 总 RNA;丝状真菌菌丝 50 mg:30–100 µg;分生孢子 1×10⁶:5–20 µg。RIN 值在严格冷链与酶法/物理破壁组合下可达 ≥7。RIN <6 通常因破壁不充分(部分细胞未释放 RNA)或 RNase 灭活不及时所致。

常见问题排查(说明书故障排查表)

① 柱子堵塞——样品用量太多(参照说明书用量建议)/样品消化不充分(用液氮或研磨仪充分研磨,延长研磨时间);② RNA 产量低——试剂准备有误(Buffer RPE 没有加入乙醇稀释或体积不准确,乙醇浓度需控制在 80%)/洗脱不充分(洗脱液需加到膜中央,增加洗脱体积或次数);③ RNA 降解严重——样品保存有误(非新鲜现取样品应尽量保存 RNA Holder 等保存液中)/提取过程耗材及环境污染(提取中使用的吸头、离心管等需经无酶处理,环境应尽量选择无酶环境或洁净环境以减少 RNase 的影响)。

Buffer RLT 裂解步骤的关键?

加 350 µL Buffer RLT(已加 β-ME 或 DTT)+ 充分涡旋 1 min 裂解真菌 → 全速(~13,400×g)离心 2 min,弃沉淀仅使用上清。若离心后上清液仍显著粘稠(多见于多糖含量高的样本),可补加 0.5 倍体积(约 175 µL)的 Buffer RLT 稀释混匀。注意:若补加了 RLT,下一步无水乙醇用量也要相应增加,保持与裂解液总量 1:1 的比例。上清加 1 倍体积无水乙醇(约 350 µL)→ 上柱。

路径 A(酶法)与路径 B(物理破壁)如何选?

路径 A(酶消化法,推荐酵母):① 加 200 µL 无菌 PBS 重悬沉淀,转入新无酶 1.5 mL 离心管;② 加 10 µL Buffer Y1,30℃ 轻轻摇晃孵育 30–40 min;③ 直接进入裂解步骤。路径 B(物理粉碎法,推荐丝状真菌):① 液氮研磨成精细粉末;② 或使用高通量研磨仪 / 破碎机配合无酶珠子粉碎;③ 转入无酶 1.5 mL 离心管直接进入裂解。

β-巯基乙醇或 DTT 是必加的吗?

建议添加,熟悉RNA提取人员可不加。操作前在 Buffer RLT 中加入 β-巯基乙醇(或 DTT)至终浓度为 1%(建议现配现用,DTT 终浓度约 40 mM),如 1 mL Buffer RLT 中加入 10 µL β-ME(或 40 µL 1M DTT 溶液)。配好的 Buffer RLT 可在 4℃ 维持稳定一个月。

起始量与适用样品?

起始量≤2×10⁷ 新鲜真菌(或酵母),4℃ 1000×g 离心 5 min 收集细胞沉淀。涵盖:① 单细胞酵母(S. cerevisiae、Pichia、Candida);② 丝状真菌菌丝体(Aspergillus、Fusarium、Penicillium);③ 真菌孢子;④ 担子菌子实体切片;⑤ 二态性真菌(Histoplasma、Sporothrix)。

真菌 RNA 提取为什么困难?

真菌细胞壁富含几丁质、β-葡聚糖、甘露蛋白,结构远比细菌厚实,常规裂解液无法穿透。本试剂盒采用「Buffer Y1 破壁酶(30℃ 30–40 min)+ Buffer RLT 化学裂解 + 硅胶膜柱纯化」组合工艺,不含酚氯仿等有毒试剂。提供两条破壁路径:路径 A(酶消化法,推荐用于酵母)和路径 B(物理粉碎法,推荐用于难裂真菌如丝状真菌,得率更高)。

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常见问题解答(9)
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产品介绍

本试剂盒可以快速地从真菌(酵母)中提取总RNA,不含酚氯仿等有毒试剂。其提取的总RNA纯度高,可用于RT-PCR、Real Time RT-PCR、mRNA差异显示、引物延伸分析、芯片分析、 Northern Blot、Dot Blot、Slot Blot、Poly A 筛选、体外翻译、RNase 保护分析和分子克隆等多种下游实验。本产品仅供科研使用,请勿用于医药、临床治疗、食品级化妆品等用途。


存储条件

Buffer Y1收到后置于-20℃保存;Buffer RLT可室温(15℃-25℃)干燥放置至少一年,加入β-巯基乙醇(或DTT)的Buffer RLT可4℃放置一个月;其他试剂室温干燥保存可至少稳定12个月。


需要额外准备的材料

 14.3 M β-巯基乙醇(β-ME) (常规购买商业化商品即为14.3 M)或1M DTT溶液

 70%乙醇:RNase-free水配制

 无水乙醇(96%-100%)

 无RNase酶的1.5mL离心管

 无RNase酶的吸头

 干净的手套

  高速离心机


开始前注意事项 请务必在使用本试剂盒之前阅读此注意事项。

 操作前在Buffer RLT中加入β-巯基乙醇(或DTT)至终浓度为1%(建议现配现用,DTT终浓度为约40mM),如1 mL Buffer RLT中加入10μL β-巯基乙醇(或40μL 1M DTT溶液)。配好的Buffer RLT可在4℃维持稳定一个月。

 Buffer RLT在储存时可能会形成沉淀, 如果有沉淀出现,请37℃加热溶解后室温使用。

 Buffer RW1作为浓缩液提供,在第一次使用前加入0.25倍体积的乙醇(96-100%)以获得工作溶液。

 Buffer RPE作为浓缩液提供,在第一次使用前加入4倍体积的乙醇(96-100%)以获得工作溶液。

 RNase-free水中不含任何抑菌因子,室温放置或操作时可能会引入细菌或真菌污染,使用时尽量注意,推荐开瓶后分装保存以减少污染风险保证实验稳定性。

 RNA在Buffer RLT中时不会被RNase降解。但提取后继续处理过程中应使用不含RNase的无酶离心管或玻璃器皿。


操作步骤:

1. 将真菌溶液(≤2×107新鲜真菌(或酵母))在4°C下以1000×g离心5分钟,在12mL或15mL的离心管中收集细胞沉淀。

2. 破壁处理(根据样本类型选择路径A或路径B):

路径A:酶消化法(推荐用于酵母)

① 加入200μL无菌PBS将沉淀重悬,并转移至新的无酶1.5 mL离心管中。

② 加入10 μL Buffer Y1,在30°C下轻轻摇晃孵育30-40 min。

③ 孵育结束后,直接进入步骤3(裂解)。

路径B:路径 B:物理粉碎法(推荐用于难裂真菌如丝状真菌,得率更高)

① 液氮研磨:将沉淀在液氮中研磨成精细粉末。

② 机械匀浆:或使用高通量研磨仪/破碎机配合无酶珠子进行粉碎。

③ 粉碎完成后,将样本转移至无酶1.5 mL离心管中,直接进入步骤3(裂解)。

3. 加入350μL Buffer RLT并充分涡旋1分钟以解真菌。全速 (~13,400×g)离心2分钟,弃沉淀并在后续步骤中仅使用上清液。
若离心后上清液仍显著粘稠(多见于多糖含量高的样本),可补加0.5倍体积(约175μL)的Buffer RLT 稀释混匀。注意:若补加了 RLT,步骤4的无水乙醇用量也要相应增加,保持与裂解液总量1:1的比例。

4. 在上清液中加入1倍体积无水乙醇(约350μL),并通过移液混合均匀。不要离心。立即进入下一步。

5. 将上述步骤溶液转移入RNase-free吸附柱中并套上2mL收集管,≥8000x g(≥10,000rpm)离心1min,弃废液,直至将溶液全部转移完成吸附。

吸附柱最大上柱量为700μL,若溶液过多可分多次上柱。后续操作若无特殊说明吸附柱均置于2mL收集管中。

6. 向吸附柱中加入700μL Buffer RW1使用前请确认Buffer RW1按要求加入0.25倍体积无水乙醇,≥8000×g(≥10,000 rpm) 离心30s,弃废液。

7. 将吸附柱重收套回收集管中,向吸附柱中加入500μL Buffer RPE(使用前请确认Buffer RPE按要求加入4倍体积无水乙醇),≥8000×g(≥10,000 rpm) 离心30s,弃废液。

8. 重复步骤7一次。

9. 倒弃滤液,将吸附柱放入收集管中, 以最大转速(~13,400×g)离心3分钟干燥柱子。

10. 将吸附柱套入新的无酶1.5mL 离心管中,并置于无酶环境中开盖静置5-10min至乙醇晾干。

若吸附柱中残留乙醇将会对纯化后的RNA的下游实验造成影响。

11. 向吸附柱膜正中央加入50-100μL RNase-FreeWater,盖上盖子室温静置2-3 min。后置于离心机中最大转速(~13,400×g)离心2min得到RNA溶液。

RNA洗脱体积不应少于30μL,否则影响洗脱效率。洗脱后的RNA溶液应立即进行下游实验或置于-80℃储存。


常见问题:

1. 柱子堵塞

 样品用量太多:减少样品用量,参照说明书中提供用量建议。

 样品消化不充分:用液氮或研磨仪充分研磨,延长研磨时间。

2. RNA产量低

 试剂准备有误:Buffer RPE没有加入乙醇稀释或体积不准确(乙醇浓度需控制在80%)。

 洗脱不充分:洗脱液需加到膜中央,增加洗脱体积或次数。

3. RNA降解严重

样品保存有误:非新鲜现取样品应尽量保存RNA Holder等保存液中。

提取过程耗材及环境污染:提取中使用的吸头、离心管等需经无酶处理,环境应尽量选择无酶环境或洁净环境以减少RNase的影响。

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