产品介绍
本试剂盒可以快速地从真菌(酵母)中提取总RNA,不含酚氯仿等有毒试剂。其提取的总RNA纯度高,可用于RT-PCR、Real Time RT-PCR、mRNA差异显示、引物延伸分析、芯片分析、 Northern Blot、Dot Blot、Slot Blot、Poly A 筛选、体外翻译、RNase 保护分析和分子克隆等多种下游实验。本产品仅供科研使用,请勿用于医药、临床治疗、食品级化妆品等用途。
存储条件
Buffer Y1收到后置于-20℃保存;Buffer RLT可室温(15℃-25℃)干燥放置至少一年,加入β-巯基乙醇(或DTT)的Buffer RLT可4℃放置一个月;其他试剂室温干燥保存可至少稳定12个月。
需要额外准备的材料
14.3 M β-巯基乙醇(β-ME) (常规购买商业化商品即为14.3 M)或1M DTT溶液
70%乙醇:RNase-free水配制
无水乙醇(96%-100%)
无RNase酶的1.5mL离心管
无RNase酶的吸头
干净的手套
高速离心机
开始前注意事项 请务必在使用本试剂盒之前阅读此注意事项。
操作前在Buffer RLT中加入β-巯基乙醇(或DTT)至终浓度为1%(建议现配现用,DTT终浓度为约40mM),如1 mL Buffer RLT中加入10μL β-巯基乙醇(或40μL 1M DTT溶液)。配好的Buffer RLT可在4℃维持稳定一个月。
Buffer RLT在储存时可能会形成沉淀, 如果有沉淀出现,请37℃加热溶解后室温使用。
Buffer RW1作为浓缩液提供,在第一次使用前加入0.25倍体积的乙醇(96-100%)以获得工作溶液。
Buffer RPE作为浓缩液提供,在第一次使用前加入4倍体积的乙醇(96-100%)以获得工作溶液。
RNase-free水中不含任何抑菌因子,室温放置或操作时可能会引入细菌或真菌污染,使用时尽量注意,推荐开瓶后分装保存以减少污染风险保证实验稳定性。
RNA在Buffer RLT中时不会被RNase降解。但提取后继续处理过程中应使用不含RNase的无酶离心管或玻璃器皿。
操作步骤:
1. 将真菌溶液(≤2×107新鲜真菌(或酵母))在4°C下以1000×g离心5分钟,在12mL或15mL的离心管中收集细胞沉淀。
2. 破壁处理(根据样本类型选择路径A或路径B):
路径A:酶消化法(推荐用于酵母)
① 加入200μL无菌PBS将沉淀重悬,并转移至新的无酶1.5 mL离心管中。
② 加入10 μL Buffer Y1,在30°C下轻轻摇晃孵育30-40 min。
③ 孵育结束后,直接进入步骤3(裂解)。
路径B:路径 B:物理粉碎法(推荐用于难裂真菌如丝状真菌,得率更高)
① 液氮研磨:将沉淀在液氮中研磨成精细粉末。
② 机械匀浆:或使用高通量研磨仪/破碎机配合无酶珠子进行粉碎。
③ 粉碎完成后,将样本转移至无酶1.5 mL离心管中,直接进入步骤3(裂解)。
3. 加入350μL Buffer RLT并充分涡旋1分钟以裂解真菌。全速 (~13,400×g)离心2分钟,弃沉淀并在后续步骤中仅使用上清液。
若离心后上清液仍显著粘稠(多见于多糖含量高的样本),可补加0.5倍体积(约175μL)的Buffer RLT 稀释混匀。注意:若补加了 RLT,步骤4的无水乙醇用量也要相应增加,保持与裂解液总量1:1的比例。
4. 在上清液中加入1倍体积无水乙醇(约350μL),并通过移液混合均匀。不要离心。立即进入下一步。
5. 将上述步骤溶液转移入RNase-free吸附柱中并套上2mL收集管,≥8000x g(≥10,000rpm)离心1min,弃废液,直至将溶液全部转移完成吸附。
吸附柱最大上柱量为700μL,若溶液过多可分多次上柱。后续操作若无特殊说明吸附柱均置于2mL收集管中。
6. 向吸附柱中加入700μL Buffer RW1(使用前请确认Buffer RW1按要求加入0.25倍体积无水乙醇),≥8000×g(≥10,000 rpm) 离心30s,弃废液。
7. 将吸附柱重收套回收集管中,向吸附柱中加入500μL Buffer RPE(使用前请确认Buffer RPE按要求加入4倍体积无水乙醇),≥8000×g(≥10,000 rpm) 离心30s,弃废液。
8. 重复步骤7一次。
9. 倒弃滤液,将吸附柱放入收集管中, 以最大转速(~13,400×g)离心3分钟干燥柱子。
10. 将吸附柱套入新的无酶1.5mL 离心管中,并置于无酶环境中开盖静置5-10min至乙醇晾干。
若吸附柱中残留乙醇将会对纯化后的RNA的下游实验造成影响。
11. 向吸附柱膜正中央加入50-100μL RNase-FreeWater,盖上盖子室温静置2-3 min。后置于离心机中最大转速(~13,400×g)离心2min得到RNA溶液。
RNA洗脱体积不应少于30μL,否则影响洗脱效率。洗脱后的RNA溶液应立即进行下游实验或置于-80℃储存。
常见问题:
1. 柱子堵塞
样品用量太多:减少样品用量,参照说明书中提供用量建议。
样品消化不充分:用液氮或研磨仪充分研磨,延长研磨时间。
2. RNA产量低
试剂准备有误:Buffer RPE没有加入乙醇稀释或体积不准确(乙醇浓度需控制在80%)。
洗脱不充分:洗脱液需加到膜中央,增加洗脱体积或次数。
3. RNA降解严重
样品保存有误:非新鲜现取样品应尽量保存RNA Holder等保存液中。
提取过程耗材及环境污染:提取中使用的吸头、离心管等需经无酶处理,环境应尽量选择无酶环境或洁净环境以减少RNase的影响。