EK-1303 FastPure动物细胞/组织总RNA提取试剂盒

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EK-1303 FastPure动物细胞/组织总RNA提取试剂盒
货号 (Catalog Number): EK-1303

产品描述

产品介绍

本试剂盒可以快速地从动物细胞中提取总RNA。其提取的总RNA 纯度高(存在基因组DNA),无蛋白质及其它杂质污染,可用于RT-PCR、qPCR、cDNA合成、引物延伸、芯片分析、Northern Blot、Dot Blot、Slot Blot、Poly A 筛选、体外翻译、RNase 保护分析和分子克隆等多种下游实验。本产品仅供科研使用,请勿用于医药、临床治疗、食品级化妆品等用途。


存储条件

室温干燥保存可至少稳定12个月。


需要额外准备的材料

 70%乙醇:RNase-free水配制

 无水乙醇(96%-100%)

 无RNase酶的1.5mL离心管

 无RNase酶的枪头

 干净的手套

 高速离心机

 物理研磨设备


开始前注意事项 请务必在使用本试剂盒之前阅读此注意事项。

 Buffer RLT在储存时可能会形成沉淀, 如果有沉淀出现,请37℃加热溶解后室温使用。

 Buffer RW1作为浓缩液提供,在第一次使用前加入0.25倍体积的乙醇(96-100%)以获得工作溶液。

 Buffer RPE作为浓缩液提供,在第一次使用前加入4倍体积的乙醇(96-100%)以获得工作溶液。

 RNase-free水中不含任何抑菌因子,室温放置或操作时可能会引入细菌或真菌污染,使用时尽量注意,推荐开瓶后分装保存以减少污染风险保证实验稳定性。

 RNA在Buffer RLT中时不会被RNase降解。但提取后继续处理过程中应使用不含RNase的无酶离心管或玻璃器皿。

 若处理 RNase 含量丰富的组织如肝脏/胰腺/肾脏/脾脏,建议在Buffer RLT中加入β-巯基乙醇(或DTT溶液亦可),如1 mL Buffer RLT中加入10μL β-巯基乙醇(或40μL 1M DTT溶液亦可)。


操作步骤:

1. 样本准备与裂解:请根据样品种类选择以下处理方式

1a. 动物细胞(离心收集法):适用于悬浮细胞或经胰酶处理脱落的贴壁细胞。

① 将细胞(不超过1×107个)转入离心管,300×g离心5 min,彻底弃除上清。

② 加入PBS重悬细胞清洗一次,再次离心弃净上清。

③ 向细胞沉淀中加入600μL Buffer RLT(细胞数< 5×106时可用350μL),涡旋或吹打至无肉眼可见细胞团块,进行步骤2。
注: 若裂解后有明显沉淀,请最大转速离心 2 min,取上清进行步骤 2。

1b. 动物细胞(皿内直接裂解法):适用于贴壁牢固的细胞,可有效减少RNA降解。

① 吸尽培养基,用PBS清洗1-2次并彻底吸干残留液体。

② 直接向皿中加入600μL Buffer RLT,涡旋或吹打至无肉眼可见细胞团块。

③ 将裂解液全部转移至新的无酶1.5 mL离心管中,进行步骤2。
注:若裂解后有明显沉淀则最大转速离心2min,取上清。

1c. 动物组织:

① 取10-30 mg 组织(切勿超过 30 mg)移入离心管,加入600μL Buffer RLT。

② 使用电动研磨机或研磨杵彻底匀浆(组织必须完全粉碎)。

③ 最大转速(~13,400×g)离心 3 min,小心吸取澄清的上清液转移至新管进行步骤2。
注:吸取上清时切勿触碰管底沉淀,以免堵塞吸附柱或污染基因组 DNA。

2. 向上述所得裂解液(细胞裂解液或组织离心上清)中加入1倍体积的 70%乙醇(使用RNase-free water配制),立即用移液器吹打混匀。

注意:混匀后可能会出现丝状沉淀,请勿离心。务必将混匀液(含沉淀)全部转移至吸附柱中。

3. 将步骤2混匀后的溶液转移入RNase-free吸附柱中并套上2mL收集管,≥8000×g(≥10,000 rpm)离心30s,弃废液。

吸附柱最大上柱量为700μL,若溶液过多可分多次上柱。后续操作若无特殊说明吸附柱均置于2mL收集管中。

4. 向吸附柱中加入700μL Buffer RW1(使用前请确认Buffer RW1是否按要求加入0.25倍体积无水乙醇, ≥8000×g(≥10,000 rpm)离心30s,弃废液。

5. 向吸附柱中加入500μL Buffer RPE使用前请确认Buffer RPE是否按要求加入4倍体积无水乙醇,≥8000×g(≥10,000 rpm)离心30s,弃废液。

6. 重复步骤5一次。

7. 倒弃滤液,将吸附柱放入收集管中, 以最大转速(~13,400×g)离心3min干燥柱膜。

8. 将吸附柱套入新的无酶1.5mL离心管管中,并置于无酶的环境中开盖静置5-10min至乙醇晾干。

若吸附柱中残留乙醇将会对纯化后的RNA的下游实验造成影响。

9. 向吸附柱膜正中央加入30-100μL RNase-free Water,盖上盖子室温静置1-3 min。后置于离心机中 ≥12,000×g(≥13,000 rpm) 离心2min得到RNA溶液。

RNA洗脱体积不应少于30μL,否则影响洗脱效率。洗脱后的RNA溶液应置于-80℃储存。


RNA纯度及浓度检测

纯度:OD260/OD280比值是衡量蛋白质污染程度的指标。高质量的RNA,OD260/OD280读数在1.8-2.1之间,比值为2.0是高质量RNA的标志。OD260/OD280读数受测定所用溶液的pH值影响。同一个RNA样品,假定在10 mM Tris pH7.5溶液中测出的OD260/OD280读数1.8-2.1之间,在水溶液中所测读数则可能在1.5-1.9之间,但这并不表示RNA不纯。

浓度:取一定量的 RNA 提取物,用RNase-free ddH2O稀释n 倍,用RNase-free ddH2O将分光光度计调零,取稀释液进行OD260, OD280测定,按照以下公式进行RNA浓度的计算:

终浓度(ng/μL)= (OD260)×(稀释倍数n)×40

产品规格

货期
现货
规格
50T、100T

应用领域

本产品适用于EK-1303、RNA提取、生物科研试剂、ECOTOP SCIENTIFIC等研究领域。ECOTOP SCIENTIFIC(广州亿涛生物科技有限公司)提供高品质生物科研试剂,服务科研院所与生物医药企业。

存储条件

室温干燥保存

品牌: ECOTOP SCIENTIFIC

常见问题 (FAQ)

提取的 RNA 应如何保存?

短期 -20℃(1 周内);长期 -80℃ 分装储存(每管单次用量 + 备份),避免反复冻融。

本试剂盒与RNAex ZOL法(EK-1300)的选择?

EK-1303(柱法):适合常规中低纤维组织、培养细胞,操作快、安全、无苯酚;EK-1300(RNAEx ZOL + 柱):富 RNase 或高纤维 / 富脂样品(脾、胰、脂肪)首选,因 RNAEx ZOL 瞬间灭活 RNase 效果更彻底。如不确定,建议两者各试 1–2 个样品后选择。

RNA 完整性差(28S/18S 比值低或弥散)怎么办?

RNA 降解原因:① 样品取材后未及时冻存或加入 RNA 保护剂(如 ES-8735 Simple Protect);② 反复冻融原始样品;③ 操作中 RNase 污染;④ 富 RNase 样品(肝、胰腺、肾、脾)未加 β-巯基乙醇或 DTT。建议:① 组织取样后 5 min 内液氮速冻 -80℃;② 实验室操作时用 EX-0411 核酸酶清除剂处理桌面与设备;③ 检查移液器吸头与管子的 RNase-free 等级;④ 富 RNase 样品改用 RNAex ZOL 工艺(EK-1300)或在 Buffer RLT 中加 β-ME / DTT。

可以用于 NGS RNA-seq 吗?

可以。NGS 文库构建对 RNA 质量要求:① RIN ≥7(凝胶电泳或 TapeStation 测定);② OD260/OD280 ≥1.9 且 OD260/OD230 ≥1.8;③ 总量 100 ng–1 µg(依文库类型);④ 严格无 gDNA 污染(必须 DNase 处理)。本试剂盒提取的 RNA 在标准操作 + DNase 处理后完全满足要求。

OD260/OD280 比值偏低(<1.8)说明什么?

OD260/OD280 比值是衡量蛋白质污染程度的指标。高质量的 RNA,OD260/OD280 读数在 1.8–2.1 之间,比值为 2.0 是高质量 RNA 的标志。OD260/OD280 读数受测定所用溶液的 pH 值影响。同一个 RNA 样品,假定在 10 mM Tris pH 7.5 溶液中测出的 OD260/OD280 读数 1.8–2.1 之间,在水溶液中所测读数则可能在 1.5–1.9 之间,但这并不表示 RNA 不纯。RNA 浓度公式:终浓度(ng/µL)= OD260 × 稀释倍数 × 40。低于 1.8 可能因匀浆不彻底、柱洗涤次数不足或 RNA 浓度过低(<5 ng/µL)测量误差大。

组织样品如何匀浆?

取 10–30 mg 组织 + 600 µL Buffer RLT,使用电动研磨机或研磨杵彻底匀浆(组织必须完全粉碎);最大转速(~13,400×g)离心 3 min,小心吸取澄清的上清液转移至新管。匀浆方法选择:① 液氮预冷研磨成细粉后转入 Buffer RLT;② 玻璃 Teflon 匀浆器手动匀浆 10–20 次;③ 电动 TissueLyser / Bullet Blender + 钢珠或锆珠 30 Hz × 30 s。

典型得率?

肝、脾等高表达组织 30 mg:50–150 µg;肌肉、脑等中等表达 30 mg:15–60 µg;培养细胞 1×10⁶ HEK293 通常 5–15 µg;HeLa 类癌细胞略高(10–20 µg)。得率主要受样品新鲜度、裂解效率、柱过载与否影响。

适用样品类型与起始量?

① 动物细胞离心收集法(≤1×10⁷ 细胞);② 皿内直接裂解法(适用于贴壁牢固的细胞,可有效减少 RNA 降解);③ 动物组织(10–30 mg,切勿超过 30 mg)。Buffer RLT 用量:细胞 600 µL;细胞数 <5×10⁶ 时可减为 350 µL;组织 600 µL。关键提示:富 RNase 组织(肝、胰腺、肾、脾)建议在 Buffer RLT 中加 β-巯基乙醇(1 mL Buffer RLT 加 10 µL β-ME)或 DTT(40 µL 1M DTT),可彻底断开 RNase 二硫键使其永久失活。

本试剂盒采用什么工艺?

本试剂盒采用纯硅胶膜柱法(不含苯酚):① Buffer RLT(异硫氰酸胍)瞬时灭活 RNase 并裂解细胞;② 加入 1 倍体积 70% 乙醇调整结合条件;③ RNA 选择性结合 RNase-free 吸附柱;④ Buffer RW1(含 0.25 倍乙醇)+ Buffer RPE(含 4 倍乙醇)洗涤;⑤ RNase-free Water 洗脱。全流程 25–35 min。可用于 RT-PCR、qPCR、cDNA 合成、Northern Blot 等下游实验。

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常见问题解答(9)
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产品介绍

本试剂盒可以快速地从动物细胞中提取总RNA。其提取的总RNA 纯度高(存在基因组DNA),无蛋白质及其它杂质污染,可用于RT-PCR、qPCR、cDNA合成、引物延伸、芯片分析、Northern Blot、Dot Blot、Slot Blot、Poly A 筛选、体外翻译、RNase 保护分析和分子克隆等多种下游实验。本产品仅供科研使用,请勿用于医药、临床治疗、食品级化妆品等用途。


存储条件

室温干燥保存可至少稳定12个月。


需要额外准备的材料

 70%乙醇:RNase-free水配制

 无水乙醇(96%-100%)

 无RNase酶的1.5mL离心管

 无RNase酶的枪头

 干净的手套

 高速离心机

 物理研磨设备


开始前注意事项 请务必在使用本试剂盒之前阅读此注意事项。

 Buffer RLT在储存时可能会形成沉淀, 如果有沉淀出现,请37℃加热溶解后室温使用。

 Buffer RW1作为浓缩液提供,在第一次使用前加入0.25倍体积的乙醇(96-100%)以获得工作溶液。

 Buffer RPE作为浓缩液提供,在第一次使用前加入4倍体积的乙醇(96-100%)以获得工作溶液。

 RNase-free水中不含任何抑菌因子,室温放置或操作时可能会引入细菌或真菌污染,使用时尽量注意,推荐开瓶后分装保存以减少污染风险保证实验稳定性。

 RNA在Buffer RLT中时不会被RNase降解。但提取后继续处理过程中应使用不含RNase的无酶离心管或玻璃器皿。

 若处理 RNase 含量丰富的组织如肝脏/胰腺/肾脏/脾脏,建议在Buffer RLT中加入β-巯基乙醇(或DTT溶液亦可),如1 mL Buffer RLT中加入10μL β-巯基乙醇(或40μL 1M DTT溶液亦可)。


操作步骤:

1. 样本准备与裂解:请根据样品种类选择以下处理方式

1a. 动物细胞(离心收集法):适用于悬浮细胞或经胰酶处理脱落的贴壁细胞。

① 将细胞(不超过1×107个)转入离心管,300×g离心5 min,彻底弃除上清。

② 加入PBS重悬细胞清洗一次,再次离心弃净上清。

③ 向细胞沉淀中加入600μL Buffer RLT(细胞数< 5×106时可用350μL),涡旋或吹打至无肉眼可见细胞团块,进行步骤2。
注: 若裂解后有明显沉淀,请最大转速离心 2 min,取上清进行步骤 2。

1b. 动物细胞(皿内直接裂解法):适用于贴壁牢固的细胞,可有效减少RNA降解。

① 吸尽培养基,用PBS清洗1-2次并彻底吸干残留液体。

② 直接向皿中加入600μL Buffer RLT,涡旋或吹打至无肉眼可见细胞团块。

③ 将裂解液全部转移至新的无酶1.5 mL离心管中,进行步骤2。
注:若裂解后有明显沉淀则最大转速离心2min,取上清。

1c. 动物组织:

① 取10-30 mg 组织(切勿超过 30 mg)移入离心管,加入600μL Buffer RLT。

② 使用电动研磨机或研磨杵彻底匀浆(组织必须完全粉碎)。

③ 最大转速(~13,400×g)离心 3 min,小心吸取澄清的上清液转移至新管进行步骤2。
注:吸取上清时切勿触碰管底沉淀,以免堵塞吸附柱或污染基因组 DNA。

2. 向上述所得裂解液(细胞裂解液或组织离心上清)中加入1倍体积的 70%乙醇(使用RNase-free water配制),立即用移液器吹打混匀。

注意:混匀后可能会出现丝状沉淀,请勿离心。务必将混匀液(含沉淀)全部转移至吸附柱中。

3. 将步骤2混匀后的溶液转移入RNase-free吸附柱中并套上2mL收集管,≥8000×g(≥10,000 rpm)离心30s,弃废液。

吸附柱最大上柱量为700μL,若溶液过多可分多次上柱。后续操作若无特殊说明吸附柱均置于2mL收集管中。

4. 向吸附柱中加入700μL Buffer RW1(使用前请确认Buffer RW1是否按要求加入0.25倍体积无水乙醇, ≥8000×g(≥10,000 rpm)离心30s,弃废液。

5. 向吸附柱中加入500μL Buffer RPE使用前请确认Buffer RPE是否按要求加入4倍体积无水乙醇,≥8000×g(≥10,000 rpm)离心30s,弃废液。

6. 重复步骤5一次。

7. 倒弃滤液,将吸附柱放入收集管中, 以最大转速(~13,400×g)离心3min干燥柱膜。

8. 将吸附柱套入新的无酶1.5mL离心管管中,并置于无酶的环境中开盖静置5-10min至乙醇晾干。

若吸附柱中残留乙醇将会对纯化后的RNA的下游实验造成影响。

9. 向吸附柱膜正中央加入30-100μL RNase-free Water,盖上盖子室温静置1-3 min。后置于离心机中 ≥12,000×g(≥13,000 rpm) 离心2min得到RNA溶液。

RNA洗脱体积不应少于30μL,否则影响洗脱效率。洗脱后的RNA溶液应置于-80℃储存。


RNA纯度及浓度检测

纯度:OD260/OD280比值是衡量蛋白质污染程度的指标。高质量的RNA,OD260/OD280读数在1.8-2.1之间,比值为2.0是高质量RNA的标志。OD260/OD280读数受测定所用溶液的pH值影响。同一个RNA样品,假定在10 mM Tris pH7.5溶液中测出的OD260/OD280读数1.8-2.1之间,在水溶液中所测读数则可能在1.5-1.9之间,但这并不表示RNA不纯。

浓度:取一定量的 RNA 提取物,用RNase-free ddH2O稀释n 倍,用RNase-free ddH2O将分光光度计调零,取稀释液进行OD260, OD280测定,按照以下公式进行RNA浓度的计算:

终浓度(ng/μL)= (OD260)×(稀释倍数n)×40

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