产品介绍
本产品适合于从5×107培养真菌样品中提取总DNA。试剂盒基于硅胶柱纯化技术,提取过程中无需使用有毒的酚氯仿抽提,也无需进行耗时的醇类沉淀,整个提取过程只需30~60min。得到的DNA可直接用于PCR、Southern Blot等实验。
存储条件
本产品除Proteinase K Solution和Lyticase Solution外,可在室温(15~25℃)保存12个月。Proteinase K Solution和Lyticase Solution请分装保存于-20℃。
需要额外准备的材料
□ 无水乙醇(96%-100%)
□ 无菌1.5mL离心管
□ 异丙醇
□ 20mg/mL RNase A溶液
□ PBS
开始前注意事项 请务必在使用本试剂盒之前阅读此注意事项。
□ 样品应避免反复冻融,否则会导致提取的DNA片段较小且提取量下降。
□ 若Buffer BB或Buffer IRB中有沉淀,可在37℃水浴中重新溶解,摇匀后使用。
□ 水浴锅温度设置至70℃。
开始前试剂准备
□ Buffer IRB按瓶子标签所示提前加入相应体积的无水乙醇
□ Buffer WB按瓶子标签所示提前加入相应体积的无水乙醇
操作步骤:
1. 取200μL真菌菌液(最多不超过5×107cells)于无酶1.5mL离心管中。
2. 10000×g离心1min或3000×g离心5min收集真菌沉淀。
3. 加入200μL无菌PBS将真菌重悬。
注意:为尽可能减少LB等真菌培养基对提取过程中的影响,可重复步骤2-3一次。
4. 加入10μL Lyticase Solution至溶液中,充分涡旋混匀15-20s后37℃孵育30-60min。
注意:过量的真菌细胞会导致破壁酶破壁效果不好,如若发现提取效果不好时,可适当增加破壁酶溶液量。对于一些难裂解的真菌(如丝状真菌或含有色素的真菌),孵育时间可延长至1-2小时。若有条件,辅助使用液氮研磨将显著提高得率。
5. (可选)加入5μL RNase A Solution(20mg/mL,自备)至消化液中,颠倒混匀,室温或37℃放置5-10min。
6. 将所得溶液加入200μL Buffer BB并充分混匀,加入20μLProteinase K Solution后立即混匀,彻底混匀后置于70℃水浴中孵育10min。
7. 将溶液从水浴中取出,并加入100μL 异丙醇充分混匀。
加入异丙醇后,可能会出现丝状或云雾状 DNA 析出,这属于正常现象。
8. 于13000×g离心5min,离心结束后取上清溶液加入核酸吸附柱(提前套在2mL收集管中)。
加入异丙醇后应立即充分颠倒混匀。离心后取上清液时,请勿触碰底部的沉淀物,以防止杂质堵塞吸附柱。
9. 以8000×g离心1min,离心完后倒掉收集管中的废液。
10. 向吸附柱中加入500μL Buffer IRB,8000×g离心1min,离心完后倒掉收集管中的废液。
11. 向吸附柱中加入500μL Buffer WB(已加入无水乙醇),8000×g离心1min,离心完后倒掉收集管中的废液。
12. 重复操作步骤11一次。
13. 倒掉收集管中的废液后将吸附柱再次套入收集管中,最大转速 (~13,400×g)离心2min 以除尽Buffer WB。将吸附柱套入新的1.5mL无酶离心管中并开盖置于室温放置5-10min彻底晾干乙醇。
注意:Buffer WB中的乙醇残留会影响后续的酶反应实验。
14. 向吸附柱膜中间位置悬空滴加50-100μL Buffer EB,室温静置2min后,最大转速 (~13,400×g)离心2min收集核酸溶液。丢弃柱子,盖上离心管盖子置于-20℃保存。
注意:洗脱体积不应小于30μL,体积过少会影响回收效率。洗脱液的pH值对于洗脱效率有很大影响。为了提高DNA的回收量,可将Buffer EB加热(约60℃)并洗脱两次,可增加约15-20%得率。
常见问题:
1. 柱子堵塞
样品用量太多:减少样品用量。真菌细胞量应控制在5×107以内。
样品裂解不充分:重新提取,加入Buffer BB及蛋白酶K后充分涡旋混匀。
2. DNA纯度不达标:
样品用量太多:减小用量。
某些真菌会产生大量的多糖或次生代谢产物:可减少起始样本量;或在加入Buffer BB裂解后,增加一次12000×g离心3 min取上清的操作,再进入异丙醇沉淀步骤。
3. DNA产量低
试剂准备有误:检查Buffer IRB和Buffer WB中是否加入无水乙醇。
样品消化不充分: 用液氮或研磨仪可提高样品消化效果,延长Proteinase K消化时间或过夜消化。
洗脱不充分:洗脱液需加到膜中央,增加洗脱体积或次数。