EK-1208 FastPure细菌基因组DNA提取试剂盒

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以下学术论文在研究中使用了本产品
CRISPR/Cas12a-Based Dynamic Light Scattering Assay for Nucleic Acid Amplification-Free and Ultrasensitive Detection of Listeria monocytogenes
Guo Yuqian; Xiong Yuanqian; Tong Weipeng; Huang Xiaolin; Xiong Yonghua Analytical Chemistry (IF: 6.700), 2025
DOI: 10.1021/acs.analchem.5c04740
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产品介绍

本产品适合于从1×109培养细菌样品中提取总DNA。试剂盒基于硅胶柱纯化技术,提取过程中无需使用有毒的酚氯仿抽提,也无需进行耗时的醇类沉淀,整个提取过程只需30~60min。得到的DNA可直接用于PCR、Southern Blot等实验。


存储条件

本产品除Proteinase K Solution和Lysozyme Solution外,可在室温(15~25℃)保存12个月。Proteinase K Solution和Lysozyme Solution请分装保存于-20℃。


需要额外准备的材料

□ 无水乙醇(96%-100%)

□ 无菌1.5mL离心管


开始前注意事项 请务必在使用本试剂盒之前阅读此注意事项。

□ 样品应避免反复冻融,否则会导致提取的DNA片段较小且提取量下降。

□ 若Buffer BB或Buffer IRB中有沉淀,可在37℃水浴中重新溶解,摇匀后使用。

□ 水浴锅温度设置至70℃。


开始前试剂准备

□ Buffer IRB按瓶子标签所示提前加入相应体积的无水乙醇

□ Buffer WB按瓶子标签所示提前加入相应体积的无水乙醇


操作步骤:

1. 取200μL细菌菌液(最多不超过1×109cells)于无酶1.5mL离心管中。

2. 10000×g离心1min或3000×g离心5min收集细菌沉淀。

3. 加入200μL无菌PBS将细菌重悬。

对于在丰富培养基中生长的细菌,建议重复步骤2-3洗涤两次,以去除残留杂质。

4. 加入30μL Lysozyme Solution至溶液中,充分涡旋混匀15-20s后37℃孵育15-30min。

对于革兰氏阳性菌,若发现裂解不彻底,可将孵育时间延长至60 min或适当增加溶菌酶用量。

5. (可选)加入5μL RNase A Solution(20mg/mL,自备)至消化液中,颠倒混匀,室温或37℃放置5-10min。

6. 将所得溶液加入200μL Buffer BB并充分混匀,加入20μL Proteinase K Solution后立即混匀,彻底混匀后置于70℃水浴中孵育10min。
水浴结束后,简短离心以收集管盖冷凝水。

7. 将溶液从水浴中取出,并加入100μL异丙醇充分混匀。
加入异丙醇后应立即充分混匀,若产生丝状沉淀属于正常现象。

8. 于13000×g离心5min,吸取上清转移至核酸吸附柱(提前套在2mL收集管中)。

9. 以8000×g离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。

10. 向吸附柱中加入500μL Buffer IRB,8000×g离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。

11. 向吸附柱中加入500μL Buffer WB(已加入无水乙醇),8000×g离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。

12. 重复操作步骤11一次。

13. 倒弃废液,最大转速 (~13,400×g)离心2 min。将吸附柱移入新的1.5 mL离心管,开盖室温静置5-10 min以彻底挥发残留乙醇。

注意:Buffer WB中的乙醇残留会影响后续的酶反应实验。

14. 向吸附柱膜中间位置悬空滴加50-100μL Buffer EB,室温静置2min后,最大转速(~13,400×g)离心2min收集核酸溶液。丢弃柱子,盖上EP 管盖子置于-20℃保存。

注意:洗脱体积不应小于30μL,体积过少会影响回收效率。洗脱液的pH值对于洗脱效率有很大影响。为了提高DNA的回收量,可将Buffer EB加热(约60℃)并洗脱两次,可增加约15-20%得率。


常见问题:

1. 柱子堵塞

 样品用量太多:减少样品用量。细菌细胞量应控制在1×109以内。

 样品裂解不充分:重新提取,加入Buffer BB及蛋白酶K后充分涡旋混匀。

2. DNA纯度不达标:

 样品用量太多:减小用量。

3. DNA产量低

 试剂准备有误:检查Buffer IRB和Buffer WB中是否加入无水乙醇。

 样品消化不充分: 用液氮或研磨仪可提高样品消化效果,延长Proteinase K消化时间或过夜消化。

 洗脱不充分:洗脱液需加到膜中央,增加洗脱体积或次数。

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