产品介绍
本产品适合于从5~50mg动物组织或小于5×106培养细胞样品中提取总DNA。试剂盒基于硅胶柱纯化技术,提取过程中无需使用有毒的酚氯仿抽提,也无需进行耗时的醇类沉淀,整个提取过程只需30~60min。得到的DNA可直接用于PCR/Southern Blot检测等实验。
存储条件
本产品除Proteinase K Solution和RNase A Solution外,可在室温(15~25℃)保存12个月。低温下Buffer GL或Buffer GE可能会有沉淀形成,使用时需55℃水浴让沉淀完全溶解。Proteinase K溶液和RNase A溶液收到后请分装保存于-20℃。
需要额外准备的材料
□ 无水乙醇(96%-100%)
□ 无菌1.5mL离心管
开始前注意事项 请务必在使用本试剂盒之前阅读此注意事项:
□ 样品应避免反复冻融,否则会导致提取的DNA片段较小且提取量下降。
□ 若Buffer GL或Buffer GE中有沉淀,可在37℃水浴中重新溶解,摇匀后使用。
□ Proteinase K Solution和RNase A Solution建议分装保存于-20℃,反复冻融会影响其活性。
□ 小型高速离心机(~13000rpm)
□ 水浴锅温度分别设置至56℃和70℃。
开始前试剂准备
□ 按瓶子标签所示,加入相应体积的无水乙醇稀释Buffer GW,于室温密封保存。
操作步骤:
1. 请根据样品种类进行以下步骤(A为培养细胞,B为动物组织)
A. 培养细胞的消化裂解(细胞总量≤5×106个)
(1)细胞消化完成后将细胞消化混合液2300×g离心1min收集细胞,小心移去培养液留下白色细胞沉淀。
(2)加入1mL PBS溶液重悬细胞,2300×g离心1min,吸去上清溶液留下细胞沉淀。
(3)加入40µL PBS溶液,用移液器吹打以重悬细胞。
(4)加入100µL Buffer GL,涡旋15s彻底混匀。
(5)加入10µL Proteinase K溶液(20mg/mL)至样品中,再次涡旋15s。
(6)将样品置于56℃水浴15min,然后70℃水浴2min。
(7)(可选)加入5µL RNase A Solution至消化液中,颠倒混匀,室温或37℃放置15min。
B. 动物组织的消化裂解(5~50mg)
(1)把5~50mg组织研磨或剪成尽量小的碎片,转移至1.5mL 离心管中。按顺序分别加入50µL 1×PBS、50µL Buffer GL和10µL Proteinase K溶液(20mg/mL),涡旋混匀15s。56℃水浴30-60min(若组织块过大或消化慢可延长消化时间,最长可过夜),期间需颠倒混匀几次或震荡水浴。
注意:适当的组织量才能获得理想结果。过多的样品会降低产量和纯度。脾、肝、肾等富含DNA的样品不宜超过20mg,肌肉和皮肤等可达50mg。肌肉、皮肤、心肌等结缔组织较多的样本,建议使用液氮研磨或机械匀浆,否则消化极慢且容易堵柱。消化时间取决于样品类型和匀浆效果,一般组织样品需0.5-3h,老鼠尾巴需6-8h。过夜消化不影响后续的实验操作及最终结果。
(2)(可选)加入5µL RNase A Solution至消化液中,颠倒混匀,室温或37℃放置15min。
RNA消化时间取决于样品类型,肝、肾等富含RNA,需较长消化时间。
2. 加入500µL Buffer GE至消化液中,充分涡旋混匀15-20s后室温静置10min。
注意:消化完成后应无组织碎片残留,若有则12000×g离心3min弃去不溶物再执行步骤2。
3. 把吸附柱套在2mL收集管中。将上一步骤所得溶液加入柱中,12000×g离心1min。倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。
若柱子出现堵塞,可提高转速至14000×g离心3-5min。若总溶液体积超过700µL则分次上柱。
4. 向吸附柱中加入500µL Buffer GE,12000×g离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。
5. 向吸附柱中加入500µL Buffer GW(确认已加入相应体积无水乙醇),12000×g离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。
6. 重复步骤5一次。
7. 倒掉收集管中的废液后将吸附柱再次套入收集管中,最大转速 (~13,400×g)离心2min以干燥吸附柱膜。将吸附柱套入新的1.5mL离心管中并置于室温放置5-10min彻底晾干。
注意:Buffer GW中的乙醇残留会影响后续的酶反应实验。
8. 向吸附柱膜中央位置悬空滴加50-100µL Buffer EB,室温静置2min后,最大转速 (~13,400×g)离心2min收集DNA溶液并置于-20℃保存。
注意:洗脱体积不应小于30µL,体积过少会影响回收效率。洗脱液的pH值对于洗脱效率有很大影响。若后续做测序,需使用ddH2O做洗脱液,并保证其pH值在7.0-8.5范围内,pH值低于7.0会降低洗脱效率。为了提高DNA的回收量,可将Buffer EB加热(约60℃)并洗脱两次,可增加约15-20%得率。
常见问题:
1. 柱子堵塞
样品用量太多:减少样品用量。富含核酸的样品如脾、肝、肺等用量可小于20mg。
样品消化不充分:用液氮或研磨仪可提高样品消化效果,延长Proteinase K消化时间或过夜消化。
样品裂解不充分:重新提取,加入Buffer GL后充分涡旋混匀。
消化液中存在不溶解物质:若样品消化后存在明显颗粒,于12000×g离心3min弃去不溶物。
2. RNA污染:
样品RNA含量高:延长RNase消化时间至60min。
3. DNA纯度不达标:
样品裂解不充分:重新提取,加入Buffer GL后充分涡旋混匀。
样品用量太多:减小用量。
复杂样品:对于一些富含代谢物质组织,样品经裂解消化后,用等体积酚氯仿抽提后再继续操作。
4. DNA产量低
试剂准备有误:Buffer GW没有加入乙醇稀释或体积不准确(乙醇浓度需控制在80%)。
样品消化不充分:用液氮或研磨仪可提高样品消化效果,延长Proteinase K消化时间或过夜消化。
5. DNA 降解(拖尾严重)
样品反复冻融或组织取下后未及时处理:取出的组织应立即液氮深冻或存放在RNA/DNA稳定剂(如ES-8735 Simple Protect通用型样本保存液)中。