EK-1102 PCR产物纯化试剂盒

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EK-1102 PCR产物纯化试剂盒
货号 (Catalog Number): EK-1102

产品描述

产品介绍

本试剂盒采用可高效、专一结合DNA的硅基质材料和独特的缓冲液系统,适用于从PCR产物、限制性内切酶体系、或其他酶促反应液中回收100bp-10kb的DNA片段,回收率可达90%以上,每个吸附柱每次可吸附的DNA量为20µg。使用本试剂盒回收的DNA可适用于各种常规操作,包括酶切、PCR、测序、文库筛选、连接和转化等实验。本产品仅供科研使用,请勿用于医药、临床治疗、食品及化妆品等用途。


存储条件

该试剂盒置于室温(15-25℃)干燥条件下,可保存12个月,更长时间的保存可置于2-8℃。2-8℃保存条件下,Buffer PB可能产生沉淀,使用前可在37℃水浴中预热10 min至沉淀溶解。


需要额外准备的材料

□ 无水乙醇(96%-100%)

□ 无菌1.5mL离心管


开始前注意事项 请务必在使用本试剂盒之前阅读此注意事项。

□ 本试剂盒为无选择性的回收溶液内所有DNA片段,如需回收特定片段,同时去除其他不同大小的片段,请选择琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒。

□ 回收<100bp或>10kb的DNA片段时,应加大Buffer PB的体积,延长吸附和洗脱时间。

□ 回收率与初始DNA量和洗脱体积有关,初始量越少、洗脱体积越少,回收率越低。

□ 高温及潮湿等不利环境因素对吸附柱产生影响,请将吸附柱储存于阴凉干燥的环境中。


开始前试剂准备

□ 按瓶子标签所示,加入4倍体积的无水乙醇稀释Buffer PW,于室温密封保存。

□ 确认Buffer PB溶液显示为黄色。


DNA浓度及纯度检测:

 回收得到的DNA片段可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度。

 DNA应在OD260处有显著吸收峰,OD260值为1相当于大约50μg/mL双链DNA、40μg/mL单链DNA。

 OD260/OD280比值应为1.7-2.0,如果洗脱时不使用洗脱缓冲液,而使用ddH2O比值会偏低,因为pH值和离子存在会影响光吸收值,但并不表示纯度低。


操作步骤:

1. 将5倍体积的Buffer PB添加到1倍体积的PCR样品中,然后混匀。

例如,将500µL Buffer PB添加到100µL PCR样品(不包括油的体积),无需去除石蜡油或矿物油。

2. Buffer PB与样品充分混匀后,检查颜色是否为黄色

如果混合物的颜色为橙色或紫色,则逐滴加入10-30µL 3 M 醋酸钠(pH 5.2)并混合,直到混合物颜色变成黄色。DNA吸附到膜上仅在pH ≤ 7.5时有效。Buffer PB含有一种pH指示剂,在pH ≤7.5时为黄色,在较高pH时为橙色或紫色,可通过颜色轻松确定DNA结合的最佳pH。

3. 将吸附柱套在2mL收集管中,并将上一步得到的溶液加入到吸附柱中,≥8000×g (≥10,000 rpm)离心30s,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。

吸附柱最大容量为700µL,若样品体积大于700µL,可分批加入。

4. 向吸附柱中加入500µL Buffer PW(已加入无水乙醇),≥8000×g (≥10,000 rpm)离心30s,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。

注意:如果回收的DNA是用于盐敏感的实验,例如平末端连接实验或直接测序,建议加入Buffer PW后静置2-5min后再离心。

5. 重复操作步骤4一次

6. 倒掉收集管中的废液后将吸附柱再次套入收集管中,最大转速 (~13,400×g)离心2min以干燥吸附柱膜,目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除。将吸附柱套入新的1.5mL离心管中并于室温开盖放置5-10min彻底晾干。

注意:Buffer PW中的乙醇残留会影响后续的酶反应(酶切、PCR等)实验。

7. 向吸附柱膜中位置悬空滴加30-50µL Buffer EB,盖上盖子室温静置2min后,最大转速 (~13,400×g)离心2min收集DNA溶液置于-20℃保存。

注意:洗脱体积不应小于30µL,体积过少影响回收效率。洗脱液的pH值对于洗脱效率有很大影响。若后续做测序,需使用ddH2O做洗脱液,并保证其pH值在7.0-8.5范围内,pH值低于7.0会降低洗脱效率。为了提高DNA的回收量,若追求更高产量,可用新的 Buffer EB 重复洗脱一次;若追求更高浓度,可将第一次的洗脱液重新加回膜中央再次洗脱。


常见问题:

1. 回收效率低

Buffer PB加入量不够正确测量PCR反应液体积,加入足量Buffer PB。

洗脱液体积太小:建议用Buffer EB洗脱两次,以获得最高的回收率。洗脱液必须加入柱子的膜中央。洗脱效率取决于洗脱体积和次数。

试剂准备有误:Buffer PW没有加入乙醇稀释或体积不准确(乙醇浓度需控制在80%)。

2. 下游应用不理想

 盐污染:在加入Buffer PW的步骤中,将Buffer PW加入吸附柱盖上盖子后静置5min再离心。

 纯化的DNA还含有引物二聚体:若引物二聚体污染严重,建议改用EK-1101琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒进行切胶纯化。

 乙醇污染:洗脱DNA前,打开柱子的盖子,室温晾干5-10min以彻底去除乙醇。若肉眼可见膜上有残留液体,可适当延长干燥时间。

3. A260/230比值低

 这是高盐缓冲液残留的现象。可通过增加一次Buffer PW洗涤并在离心前静置2 min来改善。

产品规格

货期
1-2天
规格
50T、100T

应用领域

本产品适用于EK-1102、凝胶核酸回收、生物科研试剂、ECOTOP SCIENTIFIC等研究领域。ECOTOP SCIENTIFIC(广州亿涛生物科技有限公司)提供高品质生物科研试剂,服务科研院所与生物医药企业。

存储条件

室温(15-25℃)干燥条件下,可保存12个月,更长时间的保存

品牌: ECOTOP SCIENTIFIC

常见问题 (FAQ)

纯化产物如何保存?

短期:4℃ 1–2 周。长期:-20℃ 分装储存,避免反复冻融。试剂盒整体在室温(15–25℃)干燥条件下可保存 12 个月,更长时间保存可置 2–8℃;2–8℃ 保存条件下 Buffer PB 可能产生沉淀,使用前 37℃ 水浴 10 min 至沉淀溶解后即可使用。储存超过 6 个月的纯化产物建议重新检测条带完整性。

本试剂盒与胶回收试剂盒(EK-1101)的选择?

若 PCR 反应中只有单一目标条带、无明显非特异性扩增和引物二聚体污染,优先选择 EK-1102(直接纯化、流程更快、回收率 ≥90%、无 UV 损伤风险);若 PCR 出现多条带、需切除非目标产物或要求严格去除引物二聚体,则选择 EK-1101 切胶回收(70 bp – 10 kb,回收率 ≥80%)。两者纯化产物兼容相同的下游应用。

洗脱液中可见乙醇气味或下游酶反应失败怎么办?

说明书明确指出:Buffer PW 中乙醇残留会影响后续酶反应(酶切、PCR 等)。规范操作:① Buffer PW 漂洗后空管最大转速 ~13,400×g 离心 2 min;② 将吸附柱套入新的 1.5 mL 离心管,开盖室温静置 5–10 min 彻底晾干,肉眼可见膜上有残留液体时延长干燥时间;③ 若回收 DNA 用于盐敏感实验(平末端连接、直接测序),可在加 Buffer PW 后静置 2–5 min 再离心;④ A260/A230 偏低通常因高盐残留,可在 PW 漂洗时静置 2 min 再离心改善。

纯化后 PCR 产物可直接用于 Sanger 测序吗?

可以。本试剂盒纯化的 PCR 产物已去除引物、dNTP 与盐离子,可直接送测。测序时建议使用 ddH₂O 洗脱并保证 pH 7.0–8.5(pH <7.0 会显著降低洗脱效率)。测序前再用 NanoDrop 检测 OD260/OD280(≥1.7)以确保无残留蛋白污染。

洗脱后产物量很低,如何排查?

按说明书故障排查表:① Buffer PB 加入量不足——必须严格按 5 倍 PCR 体积加入;② Buffer PW 准备失误——首次使用前必须按瓶身指示加 4 倍体积无水乙醇稀释(最终乙醇浓度 ~80%);③ 洗脱液必须加在膜中央且 ≥30 µL(建议 30–50 µL,预热 60℃,室温静置 2 min 再离心);④ 上样前 PCR 反应中本身无产物(先用电泳确认);⑤ Buffer PB 颜色呈橙紫色——pH 不达标,加 3 M 醋酸钠调整。追求最高回收率可重复洗脱一次。

纯化后的 DNA 可用于哪些下游应用?

纯化产物兼容大多数下游酶反应:限制性内切酶酶切、连接、Sanger 测序、二代测序文库构建、qPCR 模板、in vitro 转录、克隆转化、文库筛选等。纯化 DNA 的 OD260/OD280 通常 1.7–2.0,盐离子残留极低,不会抑制聚合酶或连接酶活性。本产品仅供科研使用,请勿用于医药、临床治疗、食品及化妆品等用途。

加入 Buffer PB 后样品颜色发紫或发橙怎么办?

Buffer PB 含 pH 指示剂,pH ≤7.5 时呈黄色(DNA 可高效结合硅胶膜),pH >7.5 时呈橙色或紫色。出现橙紫色通常因 PCR 反应体系中存在高浓度碱性 buffer。解决方法:逐滴加入 10–30 µL 3 M 醋酸钠(pH 5.2)并混匀,直到混合物颜色变回黄色再上柱。

可以处理多大体积的 PCR 反应?

Buffer PB 加入量为 PCR 反应体积的 5 倍(如 100 µL PCR 反应 + 500 µL Buffer PB)。单柱最大上样体积 700 µL,超过 700 µL 时分批多次离心上柱即可(无需更换柱子)。50 µL 标准 PCR 反应直接加 250 µL Buffer PB 后上柱即可。处理含矿物油或石蜡油的 PCR 反应时无需先去除油层。

纯化的典型回收率与适用片段范围是多少?

本试剂盒适用回收 70 bp – 10 kb 的双链 DNA,回收率可达 90% 以上,单柱单次最大吸附量 20 µg DNA。回收 <100 bp 或 >10 kb 片段时,应加大 Buffer PB 体积、延长吸附与洗脱时间,回收率会有所下降;如需保留 <100 bp 片段或专门去除引物二聚体,建议改用 EK-1101 进行胶回收。

PCR 产物纯化试剂盒的工作原理是什么?

本试剂盒采用硅基质材料 + 独特的 Buffer PB 缓冲液系统:加入 Buffer PB(含 pH 指示剂、高离液盐)后 DNA 选择性吸附到硅胶膜上;通过含乙醇的 Buffer PW 漂洗去除引物、dNTP、酶、盐离子等 PCR 反应残留;最后用 Buffer EB(弱碱性低盐)或 ddH₂O 洗脱获得纯化的 DNA。注意:本试剂盒为无选择性回收,溶液中所有 DNA 片段都会被结合,如需选择性回收特定大小片段请改用 EK-1101 凝胶 DNA 回收试剂盒。

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产品介绍

本试剂盒采用可高效、专一结合DNA的硅基质材料和独特的缓冲液系统,适用于从PCR产物、限制性内切酶体系、或其他酶促反应液中回收100bp-10kb的DNA片段,回收率可达90%以上,每个吸附柱每次可吸附的DNA量为20µg。使用本试剂盒回收的DNA可适用于各种常规操作,包括酶切、PCR、测序、文库筛选、连接和转化等实验。本产品仅供科研使用,请勿用于医药、临床治疗、食品及化妆品等用途。


存储条件

该试剂盒置于室温(15-25℃)干燥条件下,可保存12个月,更长时间的保存可置于2-8℃。2-8℃保存条件下,Buffer PB可能产生沉淀,使用前可在37℃水浴中预热10 min至沉淀溶解。


需要额外准备的材料

□ 无水乙醇(96%-100%)

□ 无菌1.5mL离心管


开始前注意事项 请务必在使用本试剂盒之前阅读此注意事项。

□ 本试剂盒为无选择性的回收溶液内所有DNA片段,如需回收特定片段,同时去除其他不同大小的片段,请选择琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒。

□ 回收<100bp或>10kb的DNA片段时,应加大Buffer PB的体积,延长吸附和洗脱时间。

□ 回收率与初始DNA量和洗脱体积有关,初始量越少、洗脱体积越少,回收率越低。

□ 高温及潮湿等不利环境因素对吸附柱产生影响,请将吸附柱储存于阴凉干燥的环境中。


开始前试剂准备

□ 按瓶子标签所示,加入4倍体积的无水乙醇稀释Buffer PW,于室温密封保存。

□ 确认Buffer PB溶液显示为黄色。


DNA浓度及纯度检测:

 回收得到的DNA片段可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度。

 DNA应在OD260处有显著吸收峰,OD260值为1相当于大约50μg/mL双链DNA、40μg/mL单链DNA。

 OD260/OD280比值应为1.7-2.0,如果洗脱时不使用洗脱缓冲液,而使用ddH2O比值会偏低,因为pH值和离子存在会影响光吸收值,但并不表示纯度低。


操作步骤:

1. 将5倍体积的Buffer PB添加到1倍体积的PCR样品中,然后混匀。

例如,将500µL Buffer PB添加到100µL PCR样品(不包括油的体积),无需去除石蜡油或矿物油。

2. Buffer PB与样品充分混匀后,检查颜色是否为黄色

如果混合物的颜色为橙色或紫色,则逐滴加入10-30µL 3 M 醋酸钠(pH 5.2)并混合,直到混合物颜色变成黄色。DNA吸附到膜上仅在pH ≤ 7.5时有效。Buffer PB含有一种pH指示剂,在pH ≤7.5时为黄色,在较高pH时为橙色或紫色,可通过颜色轻松确定DNA结合的最佳pH。

3. 将吸附柱套在2mL收集管中,并将上一步得到的溶液加入到吸附柱中,≥8000×g (≥10,000 rpm)离心30s,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。

吸附柱最大容量为700µL,若样品体积大于700µL,可分批加入。

4. 向吸附柱中加入500µL Buffer PW(已加入无水乙醇),≥8000×g (≥10,000 rpm)离心30s,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。

注意:如果回收的DNA是用于盐敏感的实验,例如平末端连接实验或直接测序,建议加入Buffer PW后静置2-5min后再离心。

5. 重复操作步骤4一次

6. 倒掉收集管中的废液后将吸附柱再次套入收集管中,最大转速 (~13,400×g)离心2min以干燥吸附柱膜,目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除。将吸附柱套入新的1.5mL离心管中并于室温开盖放置5-10min彻底晾干。

注意:Buffer PW中的乙醇残留会影响后续的酶反应(酶切、PCR等)实验。

7. 向吸附柱膜中位置悬空滴加30-50µL Buffer EB,盖上盖子室温静置2min后,最大转速 (~13,400×g)离心2min收集DNA溶液置于-20℃保存。

注意:洗脱体积不应小于30µL,体积过少影响回收效率。洗脱液的pH值对于洗脱效率有很大影响。若后续做测序,需使用ddH2O做洗脱液,并保证其pH值在7.0-8.5范围内,pH值低于7.0会降低洗脱效率。为了提高DNA的回收量,若追求更高产量,可用新的 Buffer EB 重复洗脱一次;若追求更高浓度,可将第一次的洗脱液重新加回膜中央再次洗脱。


常见问题:

1. 回收效率低

Buffer PB加入量不够正确测量PCR反应液体积,加入足量Buffer PB。

洗脱液体积太小:建议用Buffer EB洗脱两次,以获得最高的回收率。洗脱液必须加入柱子的膜中央。洗脱效率取决于洗脱体积和次数。

试剂准备有误:Buffer PW没有加入乙醇稀释或体积不准确(乙醇浓度需控制在80%)。

2. 下游应用不理想

 盐污染:在加入Buffer PW的步骤中,将Buffer PW加入吸附柱盖上盖子后静置5min再离心。

 纯化的DNA还含有引物二聚体:若引物二聚体污染严重,建议改用EK-1101琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒进行切胶纯化。

 乙醇污染:洗脱DNA前,打开柱子的盖子,室温晾干5-10min以彻底去除乙醇。若肉眼可见膜上有残留液体,可适当延长干燥时间。

3. A260/230比值低

 这是高盐缓冲液残留的现象。可通过增加一次Buffer PW洗涤并在离心前静置2 min来改善。

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